Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.19■□□□□ 0.82
UPC2Q12151 NSR1YGR159C 1245 nt20.09■□□□□ 0.81
UPC2Q12151 NOP1YDL014W 984 nt19.47■□□□□ 0.71
UPC2Q12151 MDJ1YFL016C 1536 nt18.03■□□□□ 0.48
UPC2Q12151 YKL036CYKL036C 393 nt17.99■□□□□ 0.47
UPC2Q12151 Q0297Q0297 156 nt17.14■□□□□ 0.33
UPC2Q12151 SRX1YKL086W 384 nt17.12■□□□□ 0.33
UPC2Q12151 YJL027CYJL027C 417 nt16.76■□□□□ 0.27
UPC2Q12151 SCS3YGL126W 1143 nt16.41■□□□□ 0.22
UPC2Q12151 YCR051WYCR051W 669 nt16.21■□□□□ 0.19
UPC2Q12151 DBP2YNL112W 1641 nt15.98■□□□□ 0.15
UPC2Q12151 YOL085CYOL085C 342 nt15.64■□□□□ 0.09
UPC2Q12151 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.57■□□□□ 0.08
UPC2Q12151 PKP1YIL042C 1185 nt15.44■□□□□ 0.06
UPC2Q12151 CCC1YLR220W 969 nt15.37■□□□□ 0.05
UPC2Q12151 RPP1BYDL130W 321 nt15.36■□□□□ 0.05
UPC2Q12151 YBR190WYBR190W 312 nt15.3■□□□□ 0.04
UPC2Q12151 SCJ1YMR214W 1134 nt14.92□□□□□ -0.02
UPC2Q12151 RTC3YHR087W 336 nt14.91□□□□□ -0.02
UPC2Q12151 RVS167YDR388W 1449 nt14.76□□□□□ -0.05
UPC2Q12151 PET122YER153C 765 nt14.75□□□□□ -0.05
UPC2Q12151 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UPC2Q12151 ATS1YAL020C 1002 nt14.62□□□□□ -0.07
UPC2Q12151 SCR1SCR1 522 nt14.42□□□□□ -0.1
UPC2Q12151 SHR5YOL110W 714 nt14.32□□□□□ -0.12
UPC2Q12151 RRN5YLR141W 1092 nt14.29□□□□□ -0.12
UPC2Q12151 YDJ1YNL064C 1230 nt14.17□□□□□ -0.14
UPC2Q12151 PUT4YOR348C 1884 nt14.06□□□□□ -0.16
UPC2Q12151 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.02□□□□□ -0.17
UPC2Q12151 DEP1YAL013W 1218 nt14□□□□□ -0.17
UPC2Q12151 URN1YPR152C 1398 nt13.99□□□□□ -0.17
UPC2Q12151 RSB1YOR049C 1065 nt13.92□□□□□ -0.18
UPC2Q12151 GAR1YHR089C 618 nt13.89□□□□□ -0.19
UPC2Q12151 OPI9YLR338W 858 nt13.81□□□□□ -0.2
UPC2Q12151 ARE1YCR048W 1833 nt13.79□□□□□ -0.2
UPC2Q12151 SAH1YER043C 1350 nt13.78□□□□□ -0.2
UPC2Q12151 YNL208WYNL208W 600 nt13.68□□□□□ -0.22
UPC2Q12151 RPN10YHR200W 807 nt13.64□□□□□ -0.23
UPC2Q12151 PST2YDR032C 597 nt13.59□□□□□ -0.23
UPC2Q12151 POA1YBR022W 534 nt13.56□□□□□ -0.24
UPC2Q12151 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.55□□□□□ -0.24
UPC2Q12151 TIR1YER011W 765 nt13.43□□□□□ -0.26
UPC2Q12151 SSA1YAL005C 1929 nt13.36□□□□□ -0.27
UPC2Q12151 PUN1YLR414C 792 nt13.34□□□□□ -0.27
UPC2Q12151 SSA3YBL075C 1950 nt13.34□□□□□ -0.27
UPC2Q12151 YJR018WYJR018W 363 nt13.32□□□□□ -0.28
UPC2Q12151 BSC6YOL137W 1494 nt13.29□□□□□ -0.28
UPC2Q12151 YJR120WYJR120W 351 nt13.29□□□□□ -0.28
UPC2Q12151 SRB2YHR041C 633 nt13.26□□□□□ -0.29
UPC2Q12151 PTC2YER089C 1395 nt13.25□□□□□ -0.29
UPC2Q12151 BUD23YCR047C 828 nt13.19□□□□□ -0.3
UPC2Q12151 SHU1YHL006C 453 nt13.09□□□□□ -0.31
UPC2Q12151 NAB2YGL122C 1578 nt13.06□□□□□ -0.32
UPC2Q12151 FIS1YIL065C 468 nt12.98□□□□□ -0.33
UPC2Q12151 RPP2BYDR382W 333 nt12.94□□□□□ -0.34
UPC2Q12151 YKL097CYKL097C 411 nt12.93□□□□□ -0.34
UPC2Q12151 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.92□□□□□ -0.34
UPC2Q12151 WWM1YFL010C 636 nt12.88□□□□□ -0.35
UPC2Q12151 DAL1YIR027C 1383 nt12.88□□□□□ -0.35
UPC2Q12151 SPT5YML010W 3192 nt12.87□□□□□ -0.35
UPC2Q12151 FPR4YLR449W 1179 nt12.82□□□□□ -0.36
UPC2Q12151 PHO4YFR034C 939 nt12.81□□□□□ -0.36
UPC2Q12151 INM2YDR287W 879 nt12.8□□□□□ -0.36
UPC2Q12151 BDH2YAL061W 1254 nt12.76□□□□□ -0.37
UPC2Q12151 YBL100CYBL100C 315 nt12.72□□□□□ -0.37
UPC2Q12151 HOM6YJR139C 1080 nt12.71□□□□□ -0.37
UPC2Q12151 MNP1YGL068W 585 nt12.69□□□□□ -0.38
UPC2Q12151 YGR021WYGR021W 873 nt12.65□□□□□ -0.38
UPC2Q12151 YPS1YLR120C 1710 nt12.59□□□□□ -0.39
UPC2Q12151 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.59□□□□□ -0.39
UPC2Q12151 FUN26YAL022C 1554 nt12.59□□□□□ -0.39
UPC2Q12151 YOR139CYOR139C 393 nt12.57□□□□□ -0.4
UPC2Q12151 Q0182Q0182 405 nt12.56□□□□□ -0.4
UPC2Q12151 LSM3YLR438C-A 270 nt12.54□□□□□ -0.4
UPC2Q12151 RKM5YLR137W 1104 nt12.51□□□□□ -0.41
UPC2Q12151 YDR095CYDR095C 411 nt12.5□□□□□ -0.41
UPC2Q12151 TRM9YML014W 840 nt12.48□□□□□ -0.41
UPC2Q12151 MEP2YNL142W 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
UPC2Q12151 CCT6YDR188W 1641 nt12.43□□□□□ -0.42
UPC2Q12151 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.38□□□□□ -0.43
UPC2Q12151 DCW1YKL046C 1350 nt12.35□□□□□ -0.43
UPC2Q12151 ALF1YNL148C 765 nt12.33□□□□□ -0.44
UPC2Q12151 YOL037CYOL037C 354 nt12.32□□□□□ -0.44
UPC2Q12151 SSA4YER103W 1929 nt12.31□□□□□ -0.44
UPC2Q12151 PTP1YDL230W 1008 nt12.31□□□□□ -0.44
UPC2Q12151 NPL3YDR432W 1245 nt12.31□□□□□ -0.44
UPC2Q12151 SIS1YNL007C 1059 nt12.26□□□□□ -0.45
UPC2Q12151 CAC2YML102W 1407 nt12.22□□□□□ -0.45
UPC2Q12151 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.22□□□□□ -0.45
UPC2Q12151 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.22□□□□□ -0.45
UPC2Q12151 RPP2AYOL039W 321 nt12.22□□□□□ -0.45
UPC2Q12151 EMI2YDR516C 1503 nt12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms