Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.41■□□□□ 0.54
SRP1Q02821 NOP1YDL014W 984 nt18.15■□□□□ 0.5
SRP1Q02821 NSR1YGR159C 1245 nt17.98■□□□□ 0.47
SRP1Q02821 YKL036CYKL036C 393 nt17.08■□□□□ 0.32
SRP1Q02821 YJL027CYJL027C 417 nt16.01■□□□□ 0.15
SRP1Q02821 Q0297Q0297 156 nt15.98■□□□□ 0.15
SRP1Q02821 SRX1YKL086W 384 nt15.81■□□□□ 0.12
SRP1Q02821 SCS3YGL126W 1143 nt15.71■□□□□ 0.11
SRP1Q02821 MDJ1YFL016C 1536 nt15.57■□□□□ 0.08
SRP1Q02821 YCR051WYCR051W 669 nt15□□□□□ -0.01
SRP1Q02821 YOL085CYOL085C 342 nt14.74□□□□□ -0.05
SRP1Q02821 SCJ1YMR214W 1134 nt14.55□□□□□ -0.08
SRP1Q02821 PKP1YIL042C 1185 nt14.41□□□□□ -0.1
SRP1Q02821 RPP1BYDL130W 321 nt14.33□□□□□ -0.12
SRP1Q02821 ATS1YAL020C 1002 nt14.18□□□□□ -0.14
SRP1Q02821 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SRP1Q02821 CCC1YLR220W 969 nt13.85□□□□□ -0.19
SRP1Q02821 DBP2YNL112W 1641 nt13.85□□□□□ -0.19
SRP1Q02821 SCR1SCR1 522 nt13.66□□□□□ -0.22
SRP1Q02821 PET122YER153C 765 nt13.59□□□□□ -0.23
SRP1Q02821 SSA3YBL075C 1950 nt13.58□□□□□ -0.24
SRP1Q02821 Q0182Q0182 405 nt13.49□□□□□ -0.25
SRP1Q02821 YBR190WYBR190W 312 nt13.41□□□□□ -0.26
SRP1Q02821 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.4□□□□□ -0.26
SRP1Q02821 RVS167YDR388W 1449 nt13.26□□□□□ -0.29
SRP1Q02821 RRN5YLR141W 1092 nt13.25□□□□□ -0.29
SRP1Q02821 RTC3YHR087W 336 nt13.14□□□□□ -0.31
SRP1Q02821 SSA1YAL005C 1929 nt13.13□□□□□ -0.31
SRP1Q02821 RSB1YOR049C 1065 nt13.12□□□□□ -0.31
SRP1Q02821 MOT3YMR070W 1473 nt13.07□□□□□ -0.32
SRP1Q02821 PST2YDR032C 597 nt13.05□□□□□ -0.32
SRP1Q02821 YDJ1YNL064C 1230 nt13.01□□□□□ -0.33
SRP1Q02821 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.99□□□□□ -0.33
SRP1Q02821 SHR5YOL110W 714 nt12.85□□□□□ -0.35
SRP1Q02821 YKL097CYKL097C 411 nt12.8□□□□□ -0.36
SRP1Q02821 FPS1YLL043W 2010 nt12.67□□□□□ -0.38
SRP1Q02821 GAR1YHR089C 618 nt12.59□□□□□ -0.39
SRP1Q02821 PUT4YOR348C 1884 nt12.42□□□□□ -0.42
SRP1Q02821 SHU1YHL006C 453 nt12.39□□□□□ -0.43
SRP1Q02821 DEP1YAL013W 1218 nt12.25□□□□□ -0.45
SRP1Q02821 NVJ2YPR091C 2313 nt12.22□□□□□ -0.45
SRP1Q02821 RPN10YHR200W 807 nt12.22□□□□□ -0.45
SRP1Q02821 YNL208WYNL208W 600 nt12.21□□□□□ -0.45
SRP1Q02821 URN1YPR152C 1398 nt12.19□□□□□ -0.46
SRP1Q02821 TIR1YER011W 765 nt12.17□□□□□ -0.46
SRP1Q02821 YOR139CYOR139C 393 nt12.13□□□□□ -0.47
SRP1Q02821 ARE1YCR048W 1833 nt12.09□□□□□ -0.47
SRP1Q02821 NPL3YDR432W 1245 nt12.02□□□□□ -0.49
SRP1Q02821 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.02□□□□□ -0.49
SRP1Q02821 OPI9YLR338W 858 nt12.02□□□□□ -0.49
SRP1Q02821 SAH1YER043C 1350 nt12.01□□□□□ -0.49
SRP1Q02821 POA1YBR022W 534 nt12□□□□□ -0.49
SRP1Q02821 PAC11YDR488C 1602 nt11.98□□□□□ -0.49
SRP1Q02821 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.93□□□□□ -0.5
SRP1Q02821 SPT5YML010W 3192 nt11.89□□□□□ -0.51
SRP1Q02821 YGR021WYGR021W 873 nt11.84□□□□□ -0.51
SRP1Q02821 BSC6YOL137W 1494 nt11.81□□□□□ -0.52
SRP1Q02821 YOL037CYOL037C 354 nt11.79□□□□□ -0.52
SRP1Q02821 HOM6YJR139C 1080 nt11.74□□□□□ -0.53
SRP1Q02821 RPM1RPM1 483 nt11.72□□□□□ -0.53
SRP1Q02821 SSA4YER103W 1929 nt11.71□□□□□ -0.53
SRP1Q02821 MNP1YGL068W 585 nt11.7□□□□□ -0.54
SRP1Q02821 SRB2YHR041C 633 nt11.68□□□□□ -0.54
SRP1Q02821 YJR018WYJR018W 363 nt11.68□□□□□ -0.54
SRP1Q02821 PUN1YLR414C 792 nt11.68□□□□□ -0.54
SRP1Q02821 WWM1YFL010C 636 nt11.66□□□□□ -0.54
SRP1Q02821 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.64□□□□□ -0.55
SRP1Q02821 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.64□□□□□ -0.55
SRP1Q02821 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.64□□□□□ -0.55
SRP1Q02821 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.64□□□□□ -0.55
SRP1Q02821 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.64□□□□□ -0.55
SRP1Q02821 BUD23YCR047C 828 nt11.63□□□□□ -0.55
SRP1Q02821 RPP2BYDR382W 333 nt11.62□□□□□ -0.55
SRP1Q02821 RKM5YLR137W 1104 nt11.58□□□□□ -0.56
SRP1Q02821 PTC2YER089C 1395 nt11.57□□□□□ -0.56
SRP1Q02821 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.55□□□□□ -0.56
SRP1Q02821 YJR120WYJR120W 351 nt11.5□□□□□ -0.57
SRP1Q02821 NAB2YGL122C 1578 nt11.5□□□□□ -0.57
SRP1Q02821 BDF1YLR399C 2061 nt11.46□□□□□ -0.57
SRP1Q02821 PUS2YGL063W 1113 nt11.42□□□□□ -0.58
SRP1Q02821 BDH2YAL061W 1254 nt11.42□□□□□ -0.58
SRP1Q02821 YLR281CYLR281C 468 nt11.41□□□□□ -0.58
SRP1Q02821 LSM3YLR438C-A 270 nt11.38□□□□□ -0.59
SRP1Q02821 WHI5YOR083W 888 nt11.31□□□□□ -0.6
SRP1Q02821 TAT1YBR069C 1860 nt11.27□□□□□ -0.6
SRP1Q02821 DAL1YIR027C 1383 nt11.27□□□□□ -0.61
SRP1Q02821 FIS1YIL065C 468 nt11.26□□□□□ -0.61
SRP1Q02821 INM2YDR287W 879 nt11.25□□□□□ -0.61
SRP1Q02821 FPR4YLR449W 1179 nt11.21□□□□□ -0.61
SRP1Q02821 IMP2'YIL154C 1041 nt11.18□□□□□ -0.62
SRP1Q02821 YBL100CYBL100C 315 nt11.18□□□□□ -0.62
SRP1Q02821 MRPL8YJL063C 717 nt11.17□□□□□ -0.62
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