RNA–Protein interactions for RNA: YMR198W

CIK1, Transcript of Kinesin-associated protein, yeast

Gene CIK1, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIK1	YMR198W	STE5	P32917	917 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	SLI1	P53304	468 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	NPP1	P25353	742 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	TRM2	P33753	639 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	EXG2	P52911	562 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	PUS9	Q12069	462 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	GYP7	P48365	746 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	LAS17	Q12446	633 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	HSF1	P10961	833 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	CCC2	P38995	1004 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	NCS6	P53088	359 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	SUN4	P53616	420 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	ERT1	P38140	529 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	YER158C	P40095	573 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	PFD1	P46988	109 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	MSE1	P48525	536 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	YDR306C	Q06640	478 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	NPC2	Q12408	173 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	YKE2	P52553	114 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CIK1	YMR198W	MRP8	P35719	219 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	MSS4	P38994	779 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	KIN4	Q01919	800 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	PBY1	P38254	753 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	PNS1	Q12412	539 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	RPC82	P32349	654 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	SIT1	P39980	628 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	IRR1	P40541	1150 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	PPH3	P32345	308 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	YBR184W	P38299	523 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	CHS7	P38843	316 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	AIM21	P40563	679 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	BUL1	P48524	976 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	UPC2	Q12151	913 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	STE14	P32584	239 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	KAR4	P25583	335 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	ATG19	P35193	415 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CIK1	YMR198W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	YRO2	P38079	344 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	IOC3	P43596	787 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	FMP25	Q08023	583 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	TOK1	P40310	691 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	ADE8	P04161	214 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	RPD3	P32561	433 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	STE13	P33894	931 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	ENB1	Q08299	606 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	FBP1	P09201	348 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	ALR2	P43553	858 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	UBX5	Q06682	500 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	YBR284W	P38150	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	CTF4	Q01454	927 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	LCD1	Q04377	747 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	GUP2	Q08929	609 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	YLR040C	Q07988	224 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	SED4	P25365	1065 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	TPO2	P53283	614 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	ERG5	P54781	538 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CIK1	YMR198W	TOP3	P13099	656 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	HDA1	P53973	706 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	AIM39	Q08223	395 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	TRM13	Q12383	476 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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