Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.48■□□□□ 0.71
PUS9Q12069 NSR1YGR159C 1245 nt19.35■□□□□ 0.69
PUS9Q12069 NOP1YDL014W 984 nt18.98■□□□□ 0.63
PUS9Q12069 YKL036CYKL036C 393 nt17.49■□□□□ 0.39
PUS9Q12069 MDJ1YFL016C 1536 nt17.13■□□□□ 0.33
PUS9Q12069 Q0297Q0297 156 nt16.55■□□□□ 0.24
PUS9Q12069 SRX1YKL086W 384 nt16.54■□□□□ 0.24
PUS9Q12069 YJL027CYJL027C 417 nt16.34■□□□□ 0.21
PUS9Q12069 SCS3YGL126W 1143 nt15.87■□□□□ 0.13
PUS9Q12069 YCR051WYCR051W 669 nt15.73■□□□□ 0.11
PUS9Q12069 YOL085CYOL085C 342 nt15.12■□□□□ 0.01
PUS9Q12069 DBP2YNL112W 1641 nt15.1■□□□□ 0.01
PUS9Q12069 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 PKP1YIL042C 1185 nt14.9□□□□□ -0.02
PUS9Q12069 RPP1BYDL130W 321 nt14.87□□□□□ -0.03
PUS9Q12069 CCC1YLR220W 969 nt14.83□□□□□ -0.04
PUS9Q12069 YBR190WYBR190W 312 nt14.63□□□□□ -0.07
PUS9Q12069 RTC3YHR087W 336 nt14.36□□□□□ -0.11
PUS9Q12069 RVS167YDR388W 1449 nt14.34□□□□□ -0.11
PUS9Q12069 ATS1YAL020C 1002 nt14.21□□□□□ -0.13
PUS9Q12069 PET122YER153C 765 nt14.18□□□□□ -0.14
PUS9Q12069 SCJ1YMR214W 1134 nt14.15□□□□□ -0.14
PUS9Q12069 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.14□□□□□ -0.15
PUS9Q12069 SCR1SCR1 522 nt14.11□□□□□ -0.15
PUS9Q12069 RRN5YLR141W 1092 nt13.8□□□□□ -0.2
PUS9Q12069 SHR5YOL110W 714 nt13.79□□□□□ -0.2
PUS9Q12069 YDJ1YNL064C 1230 nt13.68□□□□□ -0.22
PUS9Q12069 SSA3YBL075C 1950 nt13.66□□□□□ -0.22
PUS9Q12069 RSB1YOR049C 1065 nt13.54□□□□□ -0.24
PUS9Q12069 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.51□□□□□ -0.25
PUS9Q12069 DEP1YAL013W 1218 nt13.41□□□□□ -0.26
PUS9Q12069 URN1YPR152C 1398 nt13.41□□□□□ -0.26
PUS9Q12069 GAR1YHR089C 618 nt13.39□□□□□ -0.27
PUS9Q12069 RPN10YHR200W 807 nt13.26□□□□□ -0.29
PUS9Q12069 YNL208WYNL208W 600 nt13.21□□□□□ -0.29
PUS9Q12069 PUT4YOR348C 1884 nt13.21□□□□□ -0.3
PUS9Q12069 OPI9YLR338W 858 nt13.19□□□□□ -0.3
PUS9Q12069 PST2YDR032C 597 nt13.14□□□□□ -0.31
PUS9Q12069 SAH1YER043C 1350 nt13.1□□□□□ -0.31
PUS9Q12069 ARE1YCR048W 1833 nt12.98□□□□□ -0.33
PUS9Q12069 TIR1YER011W 765 nt12.93□□□□□ -0.34
PUS9Q12069 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.86□□□□□ -0.35
PUS9Q12069 POA1YBR022W 534 nt12.86□□□□□ -0.35
PUS9Q12069 PUN1YLR414C 792 nt12.84□□□□□ -0.35
PUS9Q12069 YJR018WYJR018W 363 nt12.8□□□□□ -0.36
PUS9Q12069 SSA1YAL005C 1929 nt12.73□□□□□ -0.37
PUS9Q12069 YKL097CYKL097C 411 nt12.67□□□□□ -0.38
PUS9Q12069 PTC2YER089C 1395 nt12.67□□□□□ -0.38
PUS9Q12069 BUD23YCR047C 828 nt12.61□□□□□ -0.39
PUS9Q12069 RPP2BYDR382W 333 nt12.6□□□□□ -0.39
PUS9Q12069 SHU1YHL006C 453 nt12.6□□□□□ -0.39
PUS9Q12069 BSC6YOL137W 1494 nt12.56□□□□□ -0.4
PUS9Q12069 YJR120WYJR120W 351 nt12.5□□□□□ -0.41
PUS9Q12069 NAB2YGL122C 1578 nt12.5□□□□□ -0.41
PUS9Q12069 SRB2YHR041C 633 nt12.45□□□□□ -0.42
PUS9Q12069 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.43□□□□□ -0.42
PUS9Q12069 INM2YDR287W 879 nt12.36□□□□□ -0.43
PUS9Q12069 FPR4YLR449W 1179 nt12.36□□□□□ -0.43
PUS9Q12069 WWM1YFL010C 636 nt12.35□□□□□ -0.43
PUS9Q12069 DAL1YIR027C 1383 nt12.34□□□□□ -0.43
PUS9Q12069 YGR021WYGR021W 873 nt12.32□□□□□ -0.44
PUS9Q12069 BDH2YAL061W 1254 nt12.29□□□□□ -0.44
PUS9Q12069 FIS1YIL065C 468 nt12.26□□□□□ -0.45
PUS9Q12069 HOM6YJR139C 1080 nt12.23□□□□□ -0.45
PUS9Q12069 YBL100CYBL100C 315 nt12.23□□□□□ -0.45
PUS9Q12069 PHO4YFR034C 939 nt12.2□□□□□ -0.46
PUS9Q12069 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.17□□□□□ -0.46
PUS9Q12069 MNP1YGL068W 585 nt12.16□□□□□ -0.46
PUS9Q12069 LSM3YLR438C-A 270 nt12.14□□□□□ -0.47
PUS9Q12069 TRM9YML014W 840 nt12.1□□□□□ -0.47
PUS9Q12069 YOR139CYOR139C 393 nt12.1□□□□□ -0.47
PUS9Q12069 NPL3YDR432W 1245 nt12.09□□□□□ -0.47
PUS9Q12069 FUN26YAL022C 1554 nt12.07□□□□□ -0.48
PUS9Q12069 RKM5YLR137W 1104 nt12.06□□□□□ -0.48
PUS9Q12069 YOL037CYOL037C 354 nt12□□□□□ -0.49
PUS9Q12069 ALF1YNL148C 765 nt11.96□□□□□ -0.49
PUS9Q12069 YPS1YLR120C 1710 nt11.94□□□□□ -0.5
PUS9Q12069 CCT6YDR188W 1641 nt11.91□□□□□ -0.5
PUS9Q12069 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
PUS9Q12069 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.88□□□□□ -0.51
PUS9Q12069 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.88□□□□□ -0.51
PUS9Q12069 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.87□□□□□ -0.51
PUS9Q12069 SPT5YML010W 3192 nt11.84□□□□□ -0.51
PUS9Q12069 MEP2YNL142W 1500 nt11.77□□□□□ -0.52
PUS9Q12069 YLR281CYLR281C 468 nt11.7□□□□□ -0.54
PUS9Q12069 SIS1YNL007C 1059 nt11.7□□□□□ -0.54
PUS9Q12069 RPP2AYOL039W 321 nt11.69□□□□□ -0.54
PUS9Q12069 WHI5YOR083W 888 nt11.68□□□□□ -0.54
PUS9Q12069 SSA4YER103W 1929 nt11.68□□□□□ -0.54
PUS9Q12069 PAC11YDR488C 1602 nt11.66□□□□□ -0.54
PUS9Q12069 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.65□□□□□ -0.54
PUS9Q12069 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.64□□□□□ -0.55
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