Protein–RNA interactions for Protein: Q12412

PNS1, Protein PNS1, yeastyeast

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PNS1Q12412 NSR1YGR159C 1245 nt18.44■□□□□ 0.54
PNS1Q12412 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.33■□□□□ 0.52
PNS1Q12412 NOP1YDL014W 984 nt18.14■□□□□ 0.49
PNS1Q12412 YKL036CYKL036C 393 nt17.26■□□□□ 0.35
PNS1Q12412 MDJ1YFL016C 1536 nt16.83■□□□□ 0.28
PNS1Q12412 YJL027CYJL027C 417 nt16.21■□□□□ 0.19
PNS1Q12412 Q0297Q0297 156 nt16.05■□□□□ 0.16
PNS1Q12412 SCS3YGL126W 1143 nt15.97■□□□□ 0.15
PNS1Q12412 SRX1YKL086W 384 nt15.82■□□□□ 0.12
PNS1Q12412 YCR051WYCR051W 669 nt15.05■□□□□ -0
PNS1Q12412 SCJ1YMR214W 1134 nt14.98□□□□□ -0.01
PNS1Q12412 YOL085CYOL085C 342 nt14.93□□□□□ -0.02
PNS1Q12412 DBP2YNL112W 1641 nt14.66□□□□□ -0.06
PNS1Q12412 PKP1YIL042C 1185 nt14.59□□□□□ -0.07
PNS1Q12412 ATS1YAL020C 1002 nt14.5□□□□□ -0.09
PNS1Q12412 YBR190WYBR190W 312 nt14.49□□□□□ -0.09
PNS1Q12412 RPP1BYDL130W 321 nt14.4□□□□□ -0.1
PNS1Q12412 RTC3YHR087W 336 nt14.19□□□□□ -0.14
PNS1Q12412 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.01□□□□□ -0.17
PNS1Q12412 CCC1YLR220W 969 nt13.95□□□□□ -0.18
PNS1Q12412 SSA3YBL075C 1950 nt13.84□□□□□ -0.19
PNS1Q12412 SCR1SCR1 522 nt13.73□□□□□ -0.21
PNS1Q12412 RVS167YDR388W 1449 nt13.72□□□□□ -0.21
PNS1Q12412 PET122YER153C 765 nt13.64□□□□□ -0.23
PNS1Q12412 PUT4YOR348C 1884 nt13.52□□□□□ -0.25
PNS1Q12412 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.39□□□□□ -0.27
PNS1Q12412 RRN5YLR141W 1092 nt13.35□□□□□ -0.27
PNS1Q12412 PST2YDR032C 597 nt13.33□□□□□ -0.28
PNS1Q12412 RSB1YOR049C 1065 nt13.24□□□□□ -0.29
PNS1Q12412 ARE1YCR048W 1833 nt13.13□□□□□ -0.31
PNS1Q12412 YKL097CYKL097C 411 nt13.1□□□□□ -0.31
PNS1Q12412 SHR5YOL110W 714 nt13.1□□□□□ -0.31
PNS1Q12412 POA1YBR022W 534 nt13.1□□□□□ -0.31
PNS1Q12412 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.09□□□□□ -0.31
PNS1Q12412 URN1YPR152C 1398 nt13.07□□□□□ -0.32
PNS1Q12412 SAH1YER043C 1350 nt13.03□□□□□ -0.32
PNS1Q12412 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.97□□□□□ -0.33
PNS1Q12412 OPI9YLR338W 858 nt12.97□□□□□ -0.33
PNS1Q12412 YDJ1YNL064C 1230 nt12.96□□□□□ -0.33
PNS1Q12412 DEP1YAL013W 1218 nt12.94□□□□□ -0.34
PNS1Q12412 BSC6YOL137W 1494 nt12.88□□□□□ -0.35
PNS1Q12412 RPN10YHR200W 807 nt12.76□□□□□ -0.37
PNS1Q12412 BUD23YCR047C 828 nt12.68□□□□□ -0.38
PNS1Q12412 YNL208WYNL208W 600 nt12.65□□□□□ -0.38
PNS1Q12412 SHU1YHL006C 453 nt12.61□□□□□ -0.39
PNS1Q12412 SPT5YML010W 3192 nt12.61□□□□□ -0.39
PNS1Q12412 PUN1YLR414C 792 nt12.58□□□□□ -0.4
PNS1Q12412 GAR1YHR089C 618 nt12.56□□□□□ -0.4
PNS1Q12412 PTC2YER089C 1395 nt12.54□□□□□ -0.4
PNS1Q12412 YJR018WYJR018W 363 nt12.44□□□□□ -0.42
PNS1Q12412 YOR139CYOR139C 393 nt12.44□□□□□ -0.42
PNS1Q12412 NAB2YGL122C 1578 nt12.43□□□□□ -0.42
PNS1Q12412 SSA4YER103W 1929 nt12.43□□□□□ -0.42
PNS1Q12412 NPL3YDR432W 1245 nt12.23□□□□□ -0.45
PNS1Q12412 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.23□□□□□ -0.45
PNS1Q12412 FPR4YLR449W 1179 nt12.18□□□□□ -0.46
PNS1Q12412 DAL1YIR027C 1383 nt12.17□□□□□ -0.46
PNS1Q12412 FIS1YIL065C 468 nt12.15□□□□□ -0.46
PNS1Q12412 MEP2YNL142W 1500 nt12.14□□□□□ -0.47
PNS1Q12412 TIR1YER011W 765 nt12.12□□□□□ -0.47
PNS1Q12412 YJR120WYJR120W 351 nt12.08□□□□□ -0.48
PNS1Q12412 INM2YDR287W 879 nt12.06□□□□□ -0.48
PNS1Q12412 RPP2BYDR382W 333 nt12.06□□□□□ -0.48
PNS1Q12412 SSA1YAL005C 1929 nt12.05□□□□□ -0.48
PNS1Q12412 PHO4YFR034C 939 nt12.04□□□□□ -0.48
PNS1Q12412 BDF1YLR399C 2061 nt11.98□□□□□ -0.49
PNS1Q12412 YPS1YLR120C 1710 nt11.98□□□□□ -0.49
PNS1Q12412 DCW1YKL046C 1350 nt11.94□□□□□ -0.5
PNS1Q12412 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PNS1Q12412 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PNS1Q12412 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PNS1Q12412 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PNS1Q12412 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PNS1Q12412 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.92□□□□□ -0.5
PNS1Q12412 YOL037CYOL037C 354 nt11.86□□□□□ -0.51
PNS1Q12412 YBL100CYBL100C 315 nt11.85□□□□□ -0.51
PNS1Q12412 YDR095CYDR095C 411 nt11.81□□□□□ -0.52
PNS1Q12412 YGR021WYGR021W 873 nt11.81□□□□□ -0.52
PNS1Q12412 TAT1YBR069C 1860 nt11.8□□□□□ -0.52
PNS1Q12412 EMI2YDR516C 1503 nt11.78□□□□□ -0.52
PNS1Q12412 HOM6YJR139C 1080 nt11.77□□□□□ -0.53
PNS1Q12412 YMR090WYMR090W 684 nt11.77□□□□□ -0.53
PNS1Q12412 MNP1YGL068W 585 nt11.76□□□□□ -0.53
PNS1Q12412 SRB2YHR041C 633 nt11.73□□□□□ -0.53
PNS1Q12412 YBR220CYBR220C 1683 nt11.71□□□□□ -0.53
PNS1Q12412 BDH2YAL061W 1254 nt11.71□□□□□ -0.53
PNS1Q12412 FUN26YAL022C 1554 nt11.7□□□□□ -0.54
PNS1Q12412 MOT3YMR070W 1473 nt11.7□□□□□ -0.54
PNS1Q12412 WWM1YFL010C 636 nt11.66□□□□□ -0.54
PNS1Q12412 ALF1YNL148C 765 nt11.66□□□□□ -0.54
PNS1Q12412 YDL221WYDL221W 552 nt11.64□□□□□ -0.55
PNS1Q12412 PUS2YGL063W 1113 nt11.63□□□□□ -0.55
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