RNA–Protein interactions for RNA: YBL039C

URA7, Transcript of Major CTP synthase isozyme (see also URA8), yeast

Gene URA7, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA7	YBL039C	SPO71	Q03868	1245 aa		6.29	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	GUD1	Q07729	489 aa		6.29	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	YPR071W	Q12346	211 aa		6.29	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	SPC29	P33419	253 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	KTR4	P38131	464 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	SAP30	P38429	201 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	HNT2	P49775	206 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	SPC19	Q03954	165 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	GYP1	Q08484	637 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	RMP1	Q12530	201 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	CHS3	P29465	1165 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	MCM10	P32354	571 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	SWI3	P32591	825 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	TMA108	P40462	946 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	MPH1	P40562	993 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	OPY2	Q06810	360 aa		6.28	□□□□□ -1.4
URA7	YBL039C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		6.27	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	IMP2'	P32351	346 aa		6.27	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	ADD66	P36040	267 aa		6.27	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	RRN3	P36070	627 aa		6.27	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	IML2	P47031	731 aa		6.27	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		6.27	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	YER152C	P10356	443 aa		6.26	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	FUS1	P11710	512 aa		6.26	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	PHO81	P17442	1178 aa		6.26	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	EMP65	P40085	556 aa		6.26	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	CAF16	P43569	289 aa		6.26	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	GLO4	Q12320	285 aa		6.26	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	MED1	Q12321	566 aa		6.26	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	BIT2	P38346	545 aa		6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	ESL1	P40456	1118 aa		6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	MEH1	Q02205	184 aa		6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	PSH1	Q12161	406 aa		6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	PPH3	P32345	308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	VPS30	Q02948	557 aa		6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	LCD1	Q04377	747 aa		6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	GNT1	Q12096	491 aa		6.25	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	MSS18	P08593	268 aa		6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	DID4	P36108	232 aa		6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	PPT1	P53043	513 aa		6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	RKM2	Q03942	479 aa		6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	RSC2	Q06488	889 aa		6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	GRC3	Q07845	632 aa		6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	YDR056C	Q12025	205 aa		6.24	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	ADE8	P04161	214 aa		6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	RGP1	P16664	663 aa		6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	DAL3	P32459	195 aa		6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	RGD1	P38339	666 aa		6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	SLD3	P53135	668 aa		6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	NPY1	P53164	384 aa		6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	YMR018W	Q04364	514 aa		6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	HOG1	P32485	435 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	YNR040W	P53736	256 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	CAF120	P53836	1060 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TRS130	Q03660	1102 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	ATG33	Q06485	197 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	RSC3	Q06639	885 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	SPS1	P08458	490 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	MLS1	P30952	554 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	SLA1	P32790	1244 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	NEM1	P38757	446 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	QRI7	P43122	407 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	VTC2	P43585	828 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	YGR153W	P48238	217 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	PEX15	Q08215	383 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
URA7	YBL039C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41

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