Protein–RNA interactions for Protein: Q06485

ATG33, Autophagy-related protein 33, yeastyeast

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG33Q06485 NSR1YGR159C 1245 nt15.37■□□□□ 0.05
ATG33Q06485 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.07■□□□□ 0
ATG33Q06485 NOP1YDL014W 984 nt14.55□□□□□ -0.08
ATG33Q06485 MDJ1YFL016C 1536 nt14.14□□□□□ -0.15
ATG33Q06485 Q0182Q0182 405 nt13.57□□□□□ -0.24
ATG33Q06485 MOT3YMR070W 1473 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG33Q06485 YKL036CYKL036C 393 nt13.03□□□□□ -0.32
ATG33Q06485 YJL027CYJL027C 417 nt13.02□□□□□ -0.33
ATG33Q06485 SRX1YKL086W 384 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG33Q06485 Q0297Q0297 156 nt12.5□□□□□ -0.41
ATG33Q06485 DBP2YNL112W 1641 nt12.24□□□□□ -0.45
ATG33Q06485 YBR190WYBR190W 312 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG33Q06485 YCR051WYCR051W 669 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG33Q06485 RTC3YHR087W 336 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG33Q06485 SSA3YBL075C 1950 nt11.86□□□□□ -0.51
ATG33Q06485 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 CCC1YLR220W 969 nt11.63□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 SCS3YGL126W 1143 nt11.61□□□□□ -0.55
ATG33Q06485 RVS167YDR388W 1449 nt11.49□□□□□ -0.57
ATG33Q06485 PUT4YOR348C 1884 nt11.4□□□□□ -0.59
ATG33Q06485 RPP1BYDL130W 321 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG33Q06485 SCJ1YMR214W 1134 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG33Q06485 YOL085CYOL085C 342 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG33Q06485 PKP1YIL042C 1185 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG33Q06485 POA1YBR022W 534 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG33Q06485 ARE1YCR048W 1833 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG33Q06485 SAH1YER043C 1350 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG33Q06485 URN1YPR152C 1398 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG33Q06485 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG33Q06485 SHR5YOL110W 714 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG33Q06485 BSC6YOL137W 1494 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG33Q06485 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.88□□□□□ -0.67
ATG33Q06485 SSA1YAL005C 1929 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG33Q06485 OPI9YLR338W 858 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG33Q06485 DEP1YAL013W 1218 nt10.84□□□□□ -0.67
ATG33Q06485 PET122YER153C 765 nt10.75□□□□□ -0.69
ATG33Q06485 BUD23YCR047C 828 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG33Q06485 RPN10YHR200W 807 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG33Q06485 SCR1SCR1 522 nt10.68□□□□□ -0.7
ATG33Q06485 SPT5YML010W 3192 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG33Q06485 SSA4YER103W 1929 nt10.59□□□□□ -0.71
ATG33Q06485 YNL208WYNL208W 600 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG33Q06485 PUN1YLR414C 792 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG33Q06485 NME1NME1 340 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG33Q06485 PTC2YER089C 1395 nt10.54□□□□□ -0.72
ATG33Q06485 YDJ1YNL064C 1230 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG33Q06485 FPS1YLL043W 2010 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG33Q06485 NAB2YGL122C 1578 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG33Q06485 YJR018WYJR018W 363 nt10.43□□□□□ -0.74
ATG33Q06485 RRN5YLR141W 1092 nt10.42□□□□□ -0.74
ATG33Q06485 GAR1YHR089C 618 nt10.41□□□□□ -0.74
ATG33Q06485 ATS1YAL020C 1002 nt10.3□□□□□ -0.76
ATG33Q06485 FPR4YLR449W 1179 nt10.27□□□□□ -0.77
ATG33Q06485 MEP2YNL142W 1500 nt10.27□□□□□ -0.77
ATG33Q06485 DAL1YIR027C 1383 nt10.22□□□□□ -0.77
ATG33Q06485 NVJ2YPR091C 2313 nt10.22□□□□□ -0.77
ATG33Q06485 FIS1YIL065C 468 nt10.2□□□□□ -0.78
ATG33Q06485 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.19□□□□□ -0.78
ATG33Q06485 BDF1YLR399C 2061 nt10.18□□□□□ -0.78
ATG33Q06485 RSB1YOR049C 1065 nt10.17□□□□□ -0.78
ATG33Q06485 INM2YDR287W 879 nt10.12□□□□□ -0.79
ATG33Q06485 PHO4YFR034C 939 nt10.12□□□□□ -0.79
ATG33Q06485 RPP2BYDR382W 333 nt10.11□□□□□ -0.79
ATG33Q06485 DCW1YKL046C 1350 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG33Q06485 YPS1YLR120C 1710 nt10.08□□□□□ -0.8
ATG33Q06485 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.07□□□□□ -0.8
ATG33Q06485 TIR1YER011W 765 nt10.06□□□□□ -0.8
ATG33Q06485 YJR120WYJR120W 351 nt10.06□□□□□ -0.8
ATG33Q06485 TAT1YBR069C 1860 nt10.03□□□□□ -0.8
ATG33Q06485 YMR090WYMR090W 684 nt10□□□□□ -0.81
ATG33Q06485 FRE6YLL051C 2139 nt10□□□□□ -0.81
ATG33Q06485 PAC11YDR488C 1602 nt9.99□□□□□ -0.81
ATG33Q06485 EMI2YDR516C 1503 nt9.97□□□□□ -0.81
ATG33Q06485 YBL100CYBL100C 315 nt9.94□□□□□ -0.82
ATG33Q06485 YDR095CYDR095C 411 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG33Q06485 YBR220CYBR220C 1683 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG33Q06485 RPM1RPM1 483 nt9.85□□□□□ -0.83
ATG33Q06485 YDL221WYDL221W 552 nt9.83□□□□□ -0.84
ATG33Q06485 ALF1YNL148C 765 nt9.81□□□□□ -0.84
ATG33Q06485 SDH1YKL148C 1923 nt9.8□□□□□ -0.84
ATG33Q06485 FUN26YAL022C 1554 nt9.8□□□□□ -0.84
ATG33Q06485 RPP2AYOL039W 321 nt9.78□□□□□ -0.84
ATG33Q06485 CAC2YML102W 1407 nt9.78□□□□□ -0.84
ATG33Q06485 BDH2YAL061W 1254 nt9.77□□□□□ -0.85
ATG33Q06485 PTP1YDL230W 1008 nt9.74□□□□□ -0.85
ATG33Q06485 TRM9YML014W 840 nt9.73□□□□□ -0.85
ATG33Q06485 SRB2YHR041C 633 nt9.71□□□□□ -0.86
ATG33Q06485 SCC4YER147C 1875 nt9.69□□□□□ -0.86
ATG33Q06485 PCH2YBR186W 1695 nt9.67□□□□□ -0.86
ATG33Q06485 SEC11YIR022W 504 nt9.66□□□□□ -0.86
ATG33Q06485 IRC15YPL017C 1500 nt9.62□□□□□ -0.87
ATG33Q06485 GUT2YIL155C 1950 nt9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.5 ms