Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPACA6W5XKT8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPACA6W5XKT8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SPACA6W5XKT8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SPACA6W5XKT8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SPACA6W5XKT8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SPACA6W5XKT8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SPACA6W5XKT8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SPACA6W5XKT8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SPACA6W5XKT8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SPACA6W5XKT8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPACA6W5XKT8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SPACA6W5XKT8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPACA6W5XKT8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPACA6W5XKT8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPACA6W5XKT8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPACA6W5XKT8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPACA6W5XKT8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPACA6W5XKT8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPACA6W5XKT8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPACA6W5XKT8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPACA6W5XKT8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPACA6W5XKT8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPACA6W5XKT8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPACA6W5XKT8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPACA6W5XKT8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPACA6W5XKT8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPACA6W5XKT8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPACA6W5XKT8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPACA6W5XKT8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPACA6W5XKT8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPACA6W5XKT8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPACA6W5XKT8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPACA6W5XKT8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPACA6W5XKT8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPACA6W5XKT8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPACA6W5XKT8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPACA6W5XKT8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPACA6W5XKT8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPACA6W5XKT8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPACA6W5XKT8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPACA6W5XKT8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPACA6W5XKT8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPACA6W5XKT8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPACA6W5XKT8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPACA6W5XKT8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPACA6W5XKT8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPACA6W5XKT8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPACA6W5XKT8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPACA6W5XKT8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPACA6W5XKT8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPACA6W5XKT8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPACA6W5XKT8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPACA6W5XKT8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPACA6W5XKT8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPACA6W5XKT8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPACA6W5XKT8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPACA6W5XKT8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPACA6W5XKT8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPACA6W5XKT8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPACA6W5XKT8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPACA6W5XKT8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPACA6W5XKT8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPACA6W5XKT8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPACA6W5XKT8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPACA6W5XKT8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPACA6W5XKT8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPACA6W5XKT8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPACA6W5XKT8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPACA6W5XKT8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPACA6W5XKT8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPACA6W5XKT8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPACA6W5XKT8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPACA6W5XKT8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPACA6W5XKT8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPACA6W5XKT8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPACA6W5XKT8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPACA6W5XKT8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPACA6W5XKT8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPACA6W5XKT8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPACA6W5XKT8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPACA6W5XKT8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPACA6W5XKT8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPACA6W5XKT8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPACA6W5XKT8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPACA6W5XKT8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPACA6W5XKT8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPACA6W5XKT8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPACA6W5XKT8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPACA6W5XKT8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPACA6W5XKT8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SPACA6W5XKT8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPACA6W5XKT8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPACA6W5XKT8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPACA6W5XKT8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPACA6W5XKT8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPACA6W5XKT8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPACA6W5XKT8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPACA6W5XKT8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPACA6W5XKT8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms