Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Z2

NEUROG3, Neurogenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROG3Q9Y4Z2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEUROG3Q9Y4Z2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEUROG3Q9Y4Z2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEUROG3Q9Y4Z2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEUROG3Q9Y4Z2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROG3Q9Y4Z2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROG3Q9Y4Z2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEUROG3Q9Y4Z2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROG3Q9Y4Z2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROG3Q9Y4Z2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROG3Q9Y4Z2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROG3Q9Y4Z2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROG3Q9Y4Z2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEUROG3Q9Y4Z2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEUROG3Q9Y4Z2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEUROG3Q9Y4Z2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROG3Q9Y4Z2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROG3Q9Y4Z2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
NEUROG3Q9Y4Z2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROG3Q9Y4Z2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEUROG3Q9Y4Z2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROG3Q9Y4Z2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROG3Q9Y4Z2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROG3Q9Y4Z2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROG3Q9Y4Z2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROG3Q9Y4Z2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROG3Q9Y4Z2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROG3Q9Y4Z2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROG3Q9Y4Z2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROG3Q9Y4Z2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROG3Q9Y4Z2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROG3Q9Y4Z2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROG3Q9Y4Z2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROG3Q9Y4Z2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROG3Q9Y4Z2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROG3Q9Y4Z2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROG3Q9Y4Z2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROG3Q9Y4Z2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROG3Q9Y4Z2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROG3Q9Y4Z2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROG3Q9Y4Z2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEUROG3Q9Y4Z2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROG3Q9Y4Z2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROG3Q9Y4Z2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROG3Q9Y4Z2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROG3Q9Y4Z2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROG3Q9Y4Z2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROG3Q9Y4Z2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROG3Q9Y4Z2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROG3Q9Y4Z2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROG3Q9Y4Z2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROG3Q9Y4Z2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROG3Q9Y4Z2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROG3Q9Y4Z2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROG3Q9Y4Z2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROG3Q9Y4Z2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROG3Q9Y4Z2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROG3Q9Y4Z2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROG3Q9Y4Z2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROG3Q9Y4Z2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROG3Q9Y4Z2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROG3Q9Y4Z2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROG3Q9Y4Z2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROG3Q9Y4Z2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROG3Q9Y4Z2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROG3Q9Y4Z2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROG3Q9Y4Z2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROG3Q9Y4Z2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROG3Q9Y4Z2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROG3Q9Y4Z2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROG3Q9Y4Z2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROG3Q9Y4Z2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROG3Q9Y4Z2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROG3Q9Y4Z2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROG3Q9Y4Z2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROG3Q9Y4Z2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROG3Q9Y4Z2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROG3Q9Y4Z2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROG3Q9Y4Z2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROG3Q9Y4Z2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROG3Q9Y4Z2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROG3Q9Y4Z2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROG3Q9Y4Z2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROG3Q9Y4Z2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROG3Q9Y4Z2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROG3Q9Y4Z2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROG3Q9Y4Z2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROG3Q9Y4Z2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROG3Q9Y4Z2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROG3Q9Y4Z2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROG3Q9Y4Z2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROG3Q9Y4Z2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROG3Q9Y4Z2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms