Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PLXND1Q9Y4D7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PLXND1Q9Y4D7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLXND1Q9Y4D7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLXND1Q9Y4D7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PLXND1Q9Y4D7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLXND1Q9Y4D7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PLXND1Q9Y4D7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PLXND1Q9Y4D7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLXND1Q9Y4D7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PLXND1Q9Y4D7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PLXND1Q9Y4D7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PLXND1Q9Y4D7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PLXND1Q9Y4D7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PLXND1Q9Y4D7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PLXND1Q9Y4D7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PLXND1Q9Y4D7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PLXND1Q9Y4D7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXND1Q9Y4D7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PLXND1Q9Y4D7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PLXND1Q9Y4D7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PLXND1Q9Y4D7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PLXND1Q9Y4D7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PLXND1Q9Y4D7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PLXND1Q9Y4D7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PLXND1Q9Y4D7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PLXND1Q9Y4D7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLXND1Q9Y4D7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLXND1Q9Y4D7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PLXND1Q9Y4D7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLXND1Q9Y4D7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PLXND1Q9Y4D7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PLXND1Q9Y4D7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PLXND1Q9Y4D7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PLXND1Q9Y4D7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PLXND1Q9Y4D7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLXND1Q9Y4D7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PLXND1Q9Y4D7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLXND1Q9Y4D7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PLXND1Q9Y4D7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PLXND1Q9Y4D7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLXND1Q9Y4D7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLXND1Q9Y4D7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PLXND1Q9Y4D7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PLXND1Q9Y4D7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PLXND1Q9Y4D7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PLXND1Q9Y4D7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLXND1Q9Y4D7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PLXND1Q9Y4D7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLXND1Q9Y4D7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLXND1Q9Y4D7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLXND1Q9Y4D7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLXND1Q9Y4D7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLXND1Q9Y4D7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PLXND1Q9Y4D7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLXND1Q9Y4D7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLXND1Q9Y4D7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLXND1Q9Y4D7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLXND1Q9Y4D7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXND1Q9Y4D7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLXND1Q9Y4D7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLXND1Q9Y4D7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLXND1Q9Y4D7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLXND1Q9Y4D7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLXND1Q9Y4D7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLXND1Q9Y4D7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLXND1Q9Y4D7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLXND1Q9Y4D7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLXND1Q9Y4D7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXND1Q9Y4D7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXND1Q9Y4D7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXND1Q9Y4D7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXND1Q9Y4D7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLXND1Q9Y4D7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLXND1Q9Y4D7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLXND1Q9Y4D7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLXND1Q9Y4D7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLXND1Q9Y4D7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLXND1Q9Y4D7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLXND1Q9Y4D7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLXND1Q9Y4D7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLXND1Q9Y4D7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLXND1Q9Y4D7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLXND1Q9Y4D7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLXND1Q9Y4D7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PLXND1Q9Y4D7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLXND1Q9Y4D7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PLXND1Q9Y4D7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLXND1Q9Y4D7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLXND1Q9Y4D7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLXND1Q9Y4D7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PLXND1Q9Y4D7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXND1Q9Y4D7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXND1Q9Y4D7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXND1Q9Y4D7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXND1Q9Y4D7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLXND1Q9Y4D7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms