Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y315

DERA, Deoxyribose-phosphate aldolase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERAQ9Y315 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DERAQ9Y315 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DERAQ9Y315 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DERAQ9Y315 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DERAQ9Y315 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36■■■■□ 3.35
DERAQ9Y315 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DERAQ9Y315 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DERAQ9Y315 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DERAQ9Y315 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
DERAQ9Y315 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DERAQ9Y315 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
DERAQ9Y315 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
DERAQ9Y315 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
DERAQ9Y315 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DERAQ9Y315 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DERAQ9Y315 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DERAQ9Y315 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DERAQ9Y315 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DERAQ9Y315 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
DERAQ9Y315 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DERAQ9Y315 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DERAQ9Y315 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DERAQ9Y315 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DERAQ9Y315 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DERAQ9Y315 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DERAQ9Y315 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DERAQ9Y315 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DERAQ9Y315 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DERAQ9Y315 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DERAQ9Y315 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DERAQ9Y315 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DERAQ9Y315 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DERAQ9Y315 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DERAQ9Y315 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
DERAQ9Y315 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DERAQ9Y315 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DERAQ9Y315 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DERAQ9Y315 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DERAQ9Y315 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DERAQ9Y315 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DERAQ9Y315 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DERAQ9Y315 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DERAQ9Y315 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DERAQ9Y315 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DERAQ9Y315 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DERAQ9Y315 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DERAQ9Y315 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
DERAQ9Y315 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DERAQ9Y315 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DERAQ9Y315 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DERAQ9Y315 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DERAQ9Y315 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DERAQ9Y315 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DERAQ9Y315 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DERAQ9Y315 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
DERAQ9Y315 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DERAQ9Y315 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DERAQ9Y315 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DERAQ9Y315 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
DERAQ9Y315 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DERAQ9Y315 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DERAQ9Y315 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DERAQ9Y315 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DERAQ9Y315 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DERAQ9Y315 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DERAQ9Y315 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DERAQ9Y315 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DERAQ9Y315 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DERAQ9Y315 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DERAQ9Y315 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DERAQ9Y315 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DERAQ9Y315 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DERAQ9Y315 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DERAQ9Y315 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DERAQ9Y315 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DERAQ9Y315 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DERAQ9Y315 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DERAQ9Y315 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DERAQ9Y315 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DERAQ9Y315 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DERAQ9Y315 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DERAQ9Y315 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DERAQ9Y315 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DERAQ9Y315 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
DERAQ9Y315 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DERAQ9Y315 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DERAQ9Y315 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DERAQ9Y315 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DERAQ9Y315 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DERAQ9Y315 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
DERAQ9Y315 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DERAQ9Y315 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DERAQ9Y315 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DERAQ9Y315 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DERAQ9Y315 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DERAQ9Y315 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DERAQ9Y315 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DERAQ9Y315 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DERAQ9Y315 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DERAQ9Y315 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms