Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FBXW11Q9UKB1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FBXW11Q9UKB1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FBXW11Q9UKB1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
FBXW11Q9UKB1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FBXW11Q9UKB1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FBXW11Q9UKB1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FBXW11Q9UKB1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
FBXW11Q9UKB1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FBXW11Q9UKB1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FBXW11Q9UKB1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FBXW11Q9UKB1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FBXW11Q9UKB1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FBXW11Q9UKB1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FBXW11Q9UKB1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FBXW11Q9UKB1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FBXW11Q9UKB1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FBXW11Q9UKB1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FBXW11Q9UKB1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
FBXW11Q9UKB1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FBXW11Q9UKB1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FBXW11Q9UKB1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FBXW11Q9UKB1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FBXW11Q9UKB1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FBXW11Q9UKB1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FBXW11Q9UKB1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FBXW11Q9UKB1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FBXW11Q9UKB1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FBXW11Q9UKB1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FBXW11Q9UKB1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FBXW11Q9UKB1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FBXW11Q9UKB1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FBXW11Q9UKB1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FBXW11Q9UKB1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
FBXW11Q9UKB1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FBXW11Q9UKB1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
FBXW11Q9UKB1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
FBXW11Q9UKB1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FBXW11Q9UKB1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FBXW11Q9UKB1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FBXW11Q9UKB1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FBXW11Q9UKB1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FBXW11Q9UKB1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FBXW11Q9UKB1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FBXW11Q9UKB1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FBXW11Q9UKB1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FBXW11Q9UKB1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FBXW11Q9UKB1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FBXW11Q9UKB1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FBXW11Q9UKB1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FBXW11Q9UKB1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FBXW11Q9UKB1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FBXW11Q9UKB1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FBXW11Q9UKB1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FBXW11Q9UKB1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FBXW11Q9UKB1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
FBXW11Q9UKB1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
FBXW11Q9UKB1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FBXW11Q9UKB1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FBXW11Q9UKB1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FBXW11Q9UKB1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FBXW11Q9UKB1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FBXW11Q9UKB1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FBXW11Q9UKB1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FBXW11Q9UKB1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FBXW11Q9UKB1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FBXW11Q9UKB1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FBXW11Q9UKB1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FBXW11Q9UKB1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FBXW11Q9UKB1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FBXW11Q9UKB1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FBXW11Q9UKB1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FBXW11Q9UKB1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FBXW11Q9UKB1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FBXW11Q9UKB1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FBXW11Q9UKB1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FBXW11Q9UKB1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXW11Q9UKB1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FBXW11Q9UKB1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FBXW11Q9UKB1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FBXW11Q9UKB1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
FBXW11Q9UKB1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FBXW11Q9UKB1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FBXW11Q9UKB1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FBXW11Q9UKB1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXW11Q9UKB1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FBXW11Q9UKB1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXW11Q9UKB1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FBXW11Q9UKB1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FBXW11Q9UKB1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FBXW11Q9UKB1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FBXW11Q9UKB1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXW11Q9UKB1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXW11Q9UKB1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXW11Q9UKB1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXW11Q9UKB1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXW11Q9UKB1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXW11Q9UKB1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FBXW11Q9UKB1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FBXW11Q9UKB1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms