Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK33

ZNF580, Zinc finger protein 580, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF580Q9UK33 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF580Q9UK33 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF580Q9UK33 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF580Q9UK33 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF580Q9UK33 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF580Q9UK33 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF580Q9UK33 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF580Q9UK33 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF580Q9UK33 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF580Q9UK33 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF580Q9UK33 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF580Q9UK33 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF580Q9UK33 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF580Q9UK33 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF580Q9UK33 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF580Q9UK33 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF580Q9UK33 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF580Q9UK33 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF580Q9UK33 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF580Q9UK33 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF580Q9UK33 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF580Q9UK33 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF580Q9UK33 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF580Q9UK33 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF580Q9UK33 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF580Q9UK33 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF580Q9UK33 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF580Q9UK33 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF580Q9UK33 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF580Q9UK33 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF580Q9UK33 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF580Q9UK33 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF580Q9UK33 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF580Q9UK33 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF580Q9UK33 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF580Q9UK33 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF580Q9UK33 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF580Q9UK33 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF580Q9UK33 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF580Q9UK33 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF580Q9UK33 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF580Q9UK33 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF580Q9UK33 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF580Q9UK33 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF580Q9UK33 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF580Q9UK33 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF580Q9UK33 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF580Q9UK33 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF580Q9UK33 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF580Q9UK33 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF580Q9UK33 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF580Q9UK33 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF580Q9UK33 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF580Q9UK33 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF580Q9UK33 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF580Q9UK33 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF580Q9UK33 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF580Q9UK33 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF580Q9UK33 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF580Q9UK33 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF580Q9UK33 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF580Q9UK33 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF580Q9UK33 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF580Q9UK33 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF580Q9UK33 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF580Q9UK33 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF580Q9UK33 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF580Q9UK33 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF580Q9UK33 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF580Q9UK33 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF580Q9UK33 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF580Q9UK33 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF580Q9UK33 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF580Q9UK33 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF580Q9UK33 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF580Q9UK33 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF580Q9UK33 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF580Q9UK33 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF580Q9UK33 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF580Q9UK33 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF580Q9UK33 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF580Q9UK33 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF580Q9UK33 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF580Q9UK33 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF580Q9UK33 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF580Q9UK33 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF580Q9UK33 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF580Q9UK33 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF580Q9UK33 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF580Q9UK33 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF580Q9UK33 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF580Q9UK33 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF580Q9UK33 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF580Q9UK33 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF580Q9UK33 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF580Q9UK33 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF580Q9UK33 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF580Q9UK33 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF580Q9UK33 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF580Q9UK33 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms