Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KLRF1Q9NZS2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KLRF1Q9NZS2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KLRF1Q9NZS2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
KLRF1Q9NZS2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KLRF1Q9NZS2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KLRF1Q9NZS2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KLRF1Q9NZS2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KLRF1Q9NZS2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KLRF1Q9NZS2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLRF1Q9NZS2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLRF1Q9NZS2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLRF1Q9NZS2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLRF1Q9NZS2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLRF1Q9NZS2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KLRF1Q9NZS2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLRF1Q9NZS2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLRF1Q9NZS2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLRF1Q9NZS2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLRF1Q9NZS2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLRF1Q9NZS2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLRF1Q9NZS2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLRF1Q9NZS2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLRF1Q9NZS2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLRF1Q9NZS2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLRF1Q9NZS2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLRF1Q9NZS2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLRF1Q9NZS2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF1Q9NZS2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF1Q9NZS2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF1Q9NZS2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRF1Q9NZS2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLRF1Q9NZS2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLRF1Q9NZS2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLRF1Q9NZS2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLRF1Q9NZS2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLRF1Q9NZS2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLRF1Q9NZS2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLRF1Q9NZS2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLRF1Q9NZS2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLRF1Q9NZS2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLRF1Q9NZS2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLRF1Q9NZS2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLRF1Q9NZS2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLRF1Q9NZS2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLRF1Q9NZS2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLRF1Q9NZS2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLRF1Q9NZS2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLRF1Q9NZS2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLRF1Q9NZS2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KLRF1Q9NZS2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KLRF1Q9NZS2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLRF1Q9NZS2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLRF1Q9NZS2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLRF1Q9NZS2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLRF1Q9NZS2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLRF1Q9NZS2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KLRF1Q9NZS2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLRF1Q9NZS2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLRF1Q9NZS2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLRF1Q9NZS2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLRF1Q9NZS2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KLRF1Q9NZS2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLRF1Q9NZS2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLRF1Q9NZS2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLRF1Q9NZS2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLRF1Q9NZS2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLRF1Q9NZS2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KLRF1Q9NZS2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLRF1Q9NZS2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLRF1Q9NZS2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLRF1Q9NZS2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLRF1Q9NZS2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLRF1Q9NZS2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLRF1Q9NZS2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLRF1Q9NZS2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KLRF1Q9NZS2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLRF1Q9NZS2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLRF1Q9NZS2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLRF1Q9NZS2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLRF1Q9NZS2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLRF1Q9NZS2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLRF1Q9NZS2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLRF1Q9NZS2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLRF1Q9NZS2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLRF1Q9NZS2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLRF1Q9NZS2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLRF1Q9NZS2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLRF1Q9NZS2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLRF1Q9NZS2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLRF1Q9NZS2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLRF1Q9NZS2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLRF1Q9NZS2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLRF1Q9NZS2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLRF1Q9NZS2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KLRF1Q9NZS2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLRF1Q9NZS2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLRF1Q9NZS2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLRF1Q9NZS2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLRF1Q9NZS2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms