Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SPG21Q9NZD8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SPG21Q9NZD8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SPG21Q9NZD8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SPG21Q9NZD8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SPG21Q9NZD8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPG21Q9NZD8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SPG21Q9NZD8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SPG21Q9NZD8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SPG21Q9NZD8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SPG21Q9NZD8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SPG21Q9NZD8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SPG21Q9NZD8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SPG21Q9NZD8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SPG21Q9NZD8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SPG21Q9NZD8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SPG21Q9NZD8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SPG21Q9NZD8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SPG21Q9NZD8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SPG21Q9NZD8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPG21Q9NZD8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPG21Q9NZD8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPG21Q9NZD8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPG21Q9NZD8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPG21Q9NZD8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPG21Q9NZD8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SPG21Q9NZD8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPG21Q9NZD8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPG21Q9NZD8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPG21Q9NZD8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPG21Q9NZD8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPG21Q9NZD8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SPG21Q9NZD8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SPG21Q9NZD8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SPG21Q9NZD8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SPG21Q9NZD8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SPG21Q9NZD8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SPG21Q9NZD8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SPG21Q9NZD8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SPG21Q9NZD8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPG21Q9NZD8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPG21Q9NZD8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SPG21Q9NZD8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SPG21Q9NZD8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPG21Q9NZD8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPG21Q9NZD8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPG21Q9NZD8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPG21Q9NZD8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SPG21Q9NZD8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SPG21Q9NZD8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPG21Q9NZD8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SPG21Q9NZD8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPG21Q9NZD8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPG21Q9NZD8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPG21Q9NZD8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPG21Q9NZD8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPG21Q9NZD8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPG21Q9NZD8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPG21Q9NZD8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPG21Q9NZD8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG21Q9NZD8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG21Q9NZD8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPG21Q9NZD8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG21Q9NZD8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG21Q9NZD8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG21Q9NZD8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG21Q9NZD8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPG21Q9NZD8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPG21Q9NZD8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPG21Q9NZD8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPG21Q9NZD8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SPG21Q9NZD8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SPG21Q9NZD8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SPG21Q9NZD8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPG21Q9NZD8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SPG21Q9NZD8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SPG21Q9NZD8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SPG21Q9NZD8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SPG21Q9NZD8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SPG21Q9NZD8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPG21Q9NZD8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPG21Q9NZD8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPG21Q9NZD8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPG21Q9NZD8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SPG21Q9NZD8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SPG21Q9NZD8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SPG21Q9NZD8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SPG21Q9NZD8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPG21Q9NZD8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPG21Q9NZD8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPG21Q9NZD8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPG21Q9NZD8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPG21Q9NZD8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPG21Q9NZD8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SPG21Q9NZD8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SPG21Q9NZD8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SPG21Q9NZD8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SPG21Q9NZD8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPG21Q9NZD8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPG21Q9NZD8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms