Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CYP39A1Q9NYL5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CYP39A1Q9NYL5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CYP39A1Q9NYL5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CYP39A1Q9NYL5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CYP39A1Q9NYL5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CYP39A1Q9NYL5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CYP39A1Q9NYL5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CYP39A1Q9NYL5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CYP39A1Q9NYL5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CYP39A1Q9NYL5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CYP39A1Q9NYL5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CYP39A1Q9NYL5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CYP39A1Q9NYL5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CYP39A1Q9NYL5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CYP39A1Q9NYL5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CYP39A1Q9NYL5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CYP39A1Q9NYL5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CYP39A1Q9NYL5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CYP39A1Q9NYL5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CYP39A1Q9NYL5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CYP39A1Q9NYL5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CYP39A1Q9NYL5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CYP39A1Q9NYL5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CYP39A1Q9NYL5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CYP39A1Q9NYL5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CYP39A1Q9NYL5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CYP39A1Q9NYL5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CYP39A1Q9NYL5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CYP39A1Q9NYL5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CYP39A1Q9NYL5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CYP39A1Q9NYL5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CYP39A1Q9NYL5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CYP39A1Q9NYL5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CYP39A1Q9NYL5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CYP39A1Q9NYL5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CYP39A1Q9NYL5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CYP39A1Q9NYL5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CYP39A1Q9NYL5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CYP39A1Q9NYL5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CYP39A1Q9NYL5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CYP39A1Q9NYL5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CYP39A1Q9NYL5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CYP39A1Q9NYL5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CYP39A1Q9NYL5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CYP39A1Q9NYL5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CYP39A1Q9NYL5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CYP39A1Q9NYL5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CYP39A1Q9NYL5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CYP39A1Q9NYL5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CYP39A1Q9NYL5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CYP39A1Q9NYL5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CYP39A1Q9NYL5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CYP39A1Q9NYL5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CYP39A1Q9NYL5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CYP39A1Q9NYL5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CYP39A1Q9NYL5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CYP39A1Q9NYL5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CYP39A1Q9NYL5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CYP39A1Q9NYL5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CYP39A1Q9NYL5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CYP39A1Q9NYL5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CYP39A1Q9NYL5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CYP39A1Q9NYL5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CYP39A1Q9NYL5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CYP39A1Q9NYL5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CYP39A1Q9NYL5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CYP39A1Q9NYL5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CYP39A1Q9NYL5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CYP39A1Q9NYL5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CYP39A1Q9NYL5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CYP39A1Q9NYL5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CYP39A1Q9NYL5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CYP39A1Q9NYL5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CYP39A1Q9NYL5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CYP39A1Q9NYL5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CYP39A1Q9NYL5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CYP39A1Q9NYL5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CYP39A1Q9NYL5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CYP39A1Q9NYL5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CYP39A1Q9NYL5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CYP39A1Q9NYL5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CYP39A1Q9NYL5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CYP39A1Q9NYL5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CYP39A1Q9NYL5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CYP39A1Q9NYL5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CYP39A1Q9NYL5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CYP39A1Q9NYL5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CYP39A1Q9NYL5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CYP39A1Q9NYL5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CYP39A1Q9NYL5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CYP39A1Q9NYL5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CYP39A1Q9NYL5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CYP39A1Q9NYL5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CYP39A1Q9NYL5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CYP39A1Q9NYL5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CYP39A1Q9NYL5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CYP39A1Q9NYL5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CYP39A1Q9NYL5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms