Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRMT1Q9NXH9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRMT1Q9NXH9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRMT1Q9NXH9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRMT1Q9NXH9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRMT1Q9NXH9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRMT1Q9NXH9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRMT1Q9NXH9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRMT1Q9NXH9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRMT1Q9NXH9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TRMT1Q9NXH9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRMT1Q9NXH9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRMT1Q9NXH9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRMT1Q9NXH9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRMT1Q9NXH9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRMT1Q9NXH9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRMT1Q9NXH9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRMT1Q9NXH9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRMT1Q9NXH9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRMT1Q9NXH9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRMT1Q9NXH9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRMT1Q9NXH9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRMT1Q9NXH9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRMT1Q9NXH9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRMT1Q9NXH9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRMT1Q9NXH9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRMT1Q9NXH9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRMT1Q9NXH9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRMT1Q9NXH9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRMT1Q9NXH9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRMT1Q9NXH9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRMT1Q9NXH9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRMT1Q9NXH9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRMT1Q9NXH9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRMT1Q9NXH9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRMT1Q9NXH9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRMT1Q9NXH9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRMT1Q9NXH9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRMT1Q9NXH9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRMT1Q9NXH9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRMT1Q9NXH9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRMT1Q9NXH9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRMT1Q9NXH9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRMT1Q9NXH9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRMT1Q9NXH9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRMT1Q9NXH9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRMT1Q9NXH9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRMT1Q9NXH9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRMT1Q9NXH9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRMT1Q9NXH9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRMT1Q9NXH9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRMT1Q9NXH9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRMT1Q9NXH9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRMT1Q9NXH9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRMT1Q9NXH9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRMT1Q9NXH9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRMT1Q9NXH9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRMT1Q9NXH9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRMT1Q9NXH9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRMT1Q9NXH9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRMT1Q9NXH9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRMT1Q9NXH9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRMT1Q9NXH9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TRMT1Q9NXH9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRMT1Q9NXH9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRMT1Q9NXH9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRMT1Q9NXH9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRMT1Q9NXH9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRMT1Q9NXH9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRMT1Q9NXH9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRMT1Q9NXH9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRMT1Q9NXH9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRMT1Q9NXH9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRMT1Q9NXH9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRMT1Q9NXH9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRMT1Q9NXH9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRMT1Q9NXH9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRMT1Q9NXH9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRMT1Q9NXH9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRMT1Q9NXH9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRMT1Q9NXH9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRMT1Q9NXH9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRMT1Q9NXH9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRMT1Q9NXH9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRMT1Q9NXH9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRMT1Q9NXH9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRMT1Q9NXH9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRMT1Q9NXH9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRMT1Q9NXH9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRMT1Q9NXH9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRMT1Q9NXH9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRMT1Q9NXH9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRMT1Q9NXH9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRMT1Q9NXH9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRMT1Q9NXH9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRMT1Q9NXH9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRMT1Q9NXH9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRMT1Q9NXH9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRMT1Q9NXH9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms