Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG6

P4HTM, Transmembrane prolyl 4-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HTMQ9NXG6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
P4HTMQ9NXG6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
P4HTMQ9NXG6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
P4HTMQ9NXG6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
P4HTMQ9NXG6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
P4HTMQ9NXG6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
P4HTMQ9NXG6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
P4HTMQ9NXG6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
P4HTMQ9NXG6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
P4HTMQ9NXG6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
P4HTMQ9NXG6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
P4HTMQ9NXG6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
P4HTMQ9NXG6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
P4HTMQ9NXG6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
P4HTMQ9NXG6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
P4HTMQ9NXG6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
P4HTMQ9NXG6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
P4HTMQ9NXG6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
P4HTMQ9NXG6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
P4HTMQ9NXG6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
P4HTMQ9NXG6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P4HTMQ9NXG6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
P4HTMQ9NXG6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
P4HTMQ9NXG6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
P4HTMQ9NXG6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
P4HTMQ9NXG6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
P4HTMQ9NXG6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
P4HTMQ9NXG6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
P4HTMQ9NXG6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
P4HTMQ9NXG6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
P4HTMQ9NXG6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
P4HTMQ9NXG6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P4HTMQ9NXG6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
P4HTMQ9NXG6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
P4HTMQ9NXG6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
P4HTMQ9NXG6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
P4HTMQ9NXG6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
P4HTMQ9NXG6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
P4HTMQ9NXG6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
P4HTMQ9NXG6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
P4HTMQ9NXG6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
P4HTMQ9NXG6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
P4HTMQ9NXG6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
P4HTMQ9NXG6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
P4HTMQ9NXG6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
P4HTMQ9NXG6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
P4HTMQ9NXG6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
P4HTMQ9NXG6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
P4HTMQ9NXG6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
P4HTMQ9NXG6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
P4HTMQ9NXG6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P4HTMQ9NXG6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
P4HTMQ9NXG6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P4HTMQ9NXG6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
P4HTMQ9NXG6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
P4HTMQ9NXG6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
P4HTMQ9NXG6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
P4HTMQ9NXG6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
P4HTMQ9NXG6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
P4HTMQ9NXG6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HTMQ9NXG6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
P4HTMQ9NXG6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
P4HTMQ9NXG6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P4HTMQ9NXG6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P4HTMQ9NXG6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P4HTMQ9NXG6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
P4HTMQ9NXG6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
P4HTMQ9NXG6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
P4HTMQ9NXG6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
P4HTMQ9NXG6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
P4HTMQ9NXG6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
P4HTMQ9NXG6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
P4HTMQ9NXG6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
P4HTMQ9NXG6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P4HTMQ9NXG6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4HTMQ9NXG6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4HTMQ9NXG6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4HTMQ9NXG6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4HTMQ9NXG6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
P4HTMQ9NXG6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
P4HTMQ9NXG6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
P4HTMQ9NXG6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P4HTMQ9NXG6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
P4HTMQ9NXG6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
P4HTMQ9NXG6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
P4HTMQ9NXG6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
P4HTMQ9NXG6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
P4HTMQ9NXG6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
P4HTMQ9NXG6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
P4HTMQ9NXG6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P4HTMQ9NXG6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P4HTMQ9NXG6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P4HTMQ9NXG6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P4HTMQ9NXG6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P4HTMQ9NXG6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
P4HTMQ9NXG6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P4HTMQ9NXG6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P4HTMQ9NXG6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
P4HTMQ9NXG6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
P4HTMQ9NXG6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms