Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUC0

SERTAD4, SERTA domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERTAD4Q9NUC0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERTAD4Q9NUC0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERTAD4Q9NUC0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERTAD4Q9NUC0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERTAD4Q9NUC0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SERTAD4Q9NUC0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERTAD4Q9NUC0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERTAD4Q9NUC0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SERTAD4Q9NUC0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SERTAD4Q9NUC0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SERTAD4Q9NUC0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERTAD4Q9NUC0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERTAD4Q9NUC0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERTAD4Q9NUC0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERTAD4Q9NUC0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERTAD4Q9NUC0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERTAD4Q9NUC0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERTAD4Q9NUC0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERTAD4Q9NUC0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERTAD4Q9NUC0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERTAD4Q9NUC0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERTAD4Q9NUC0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERTAD4Q9NUC0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERTAD4Q9NUC0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERTAD4Q9NUC0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERTAD4Q9NUC0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERTAD4Q9NUC0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERTAD4Q9NUC0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERTAD4Q9NUC0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERTAD4Q9NUC0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERTAD4Q9NUC0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERTAD4Q9NUC0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERTAD4Q9NUC0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERTAD4Q9NUC0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERTAD4Q9NUC0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERTAD4Q9NUC0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERTAD4Q9NUC0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERTAD4Q9NUC0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERTAD4Q9NUC0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERTAD4Q9NUC0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERTAD4Q9NUC0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERTAD4Q9NUC0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERTAD4Q9NUC0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERTAD4Q9NUC0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERTAD4Q9NUC0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERTAD4Q9NUC0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERTAD4Q9NUC0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERTAD4Q9NUC0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERTAD4Q9NUC0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SERTAD4Q9NUC0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERTAD4Q9NUC0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERTAD4Q9NUC0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERTAD4Q9NUC0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERTAD4Q9NUC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERTAD4Q9NUC0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SERTAD4Q9NUC0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SERTAD4Q9NUC0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERTAD4Q9NUC0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERTAD4Q9NUC0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERTAD4Q9NUC0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERTAD4Q9NUC0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SERTAD4Q9NUC0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERTAD4Q9NUC0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERTAD4Q9NUC0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERTAD4Q9NUC0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERTAD4Q9NUC0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERTAD4Q9NUC0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERTAD4Q9NUC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERTAD4Q9NUC0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERTAD4Q9NUC0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERTAD4Q9NUC0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERTAD4Q9NUC0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERTAD4Q9NUC0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERTAD4Q9NUC0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERTAD4Q9NUC0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERTAD4Q9NUC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERTAD4Q9NUC0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERTAD4Q9NUC0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERTAD4Q9NUC0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERTAD4Q9NUC0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERTAD4Q9NUC0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERTAD4Q9NUC0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERTAD4Q9NUC0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERTAD4Q9NUC0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERTAD4Q9NUC0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERTAD4Q9NUC0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERTAD4Q9NUC0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERTAD4Q9NUC0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERTAD4Q9NUC0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERTAD4Q9NUC0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERTAD4Q9NUC0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms