Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ATP8A2Q9NTI2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ATP8A2Q9NTI2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ATP8A2Q9NTI2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ATP8A2Q9NTI2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ATP8A2Q9NTI2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ATP8A2Q9NTI2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
ATP8A2Q9NTI2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ATP8A2Q9NTI2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ATP8A2Q9NTI2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ATP8A2Q9NTI2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ATP8A2Q9NTI2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATP8A2Q9NTI2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP8A2Q9NTI2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP8A2Q9NTI2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP8A2Q9NTI2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ATP8A2Q9NTI2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP8A2Q9NTI2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ATP8A2Q9NTI2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP8A2Q9NTI2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP8A2Q9NTI2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP8A2Q9NTI2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP8A2Q9NTI2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP8A2Q9NTI2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
ATP8A2Q9NTI2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP8A2Q9NTI2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP8A2Q9NTI2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP8A2Q9NTI2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP8A2Q9NTI2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP8A2Q9NTI2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATP8A2Q9NTI2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ATP8A2Q9NTI2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ATP8A2Q9NTI2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ATP8A2Q9NTI2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP8A2Q9NTI2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP8A2Q9NTI2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP8A2Q9NTI2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP8A2Q9NTI2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP8A2Q9NTI2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP8A2Q9NTI2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ATP8A2Q9NTI2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATP8A2Q9NTI2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP8A2Q9NTI2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP8A2Q9NTI2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP8A2Q9NTI2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ATP8A2Q9NTI2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATP8A2Q9NTI2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATP8A2Q9NTI2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP8A2Q9NTI2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ATP8A2Q9NTI2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP8A2Q9NTI2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP8A2Q9NTI2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATP8A2Q9NTI2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ATP8A2Q9NTI2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP8A2Q9NTI2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP8A2Q9NTI2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP8A2Q9NTI2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATP8A2Q9NTI2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP8A2Q9NTI2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP8A2Q9NTI2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP8A2Q9NTI2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATP8A2Q9NTI2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP8A2Q9NTI2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP8A2Q9NTI2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP8A2Q9NTI2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP8A2Q9NTI2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP8A2Q9NTI2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP8A2Q9NTI2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ATP8A2Q9NTI2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATP8A2Q9NTI2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP8A2Q9NTI2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATP8A2Q9NTI2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP8A2Q9NTI2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP8A2Q9NTI2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP8A2Q9NTI2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP8A2Q9NTI2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATP8A2Q9NTI2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ATP8A2Q9NTI2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP8A2Q9NTI2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP8A2Q9NTI2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP8A2Q9NTI2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP8A2Q9NTI2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP8A2Q9NTI2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP8A2Q9NTI2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP8A2Q9NTI2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP8A2Q9NTI2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP8A2Q9NTI2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP8A2Q9NTI2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP8A2Q9NTI2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ATP8A2Q9NTI2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATP8A2Q9NTI2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ATP8A2Q9NTI2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP8A2Q9NTI2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP8A2Q9NTI2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP8A2Q9NTI2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP8A2Q9NTI2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP8A2Q9NTI2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms