Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS40

KCNH7, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH7Q9NS40 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KCNH7Q9NS40 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
KCNH7Q9NS40 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNH7Q9NS40 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNH7Q9NS40 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNH7Q9NS40 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNH7Q9NS40 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNH7Q9NS40 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
KCNH7Q9NS40 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNH7Q9NS40 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNH7Q9NS40 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
KCNH7Q9NS40 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KCNH7Q9NS40 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KCNH7Q9NS40 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KCNH7Q9NS40 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KCNH7Q9NS40 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH7Q9NS40 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNH7Q9NS40 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KCNH7Q9NS40 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNH7Q9NS40 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNH7Q9NS40 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KCNH7Q9NS40 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KCNH7Q9NS40 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KCNH7Q9NS40 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KCNH7Q9NS40 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KCNH7Q9NS40 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KCNH7Q9NS40 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KCNH7Q9NS40 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KCNH7Q9NS40 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KCNH7Q9NS40 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KCNH7Q9NS40 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KCNH7Q9NS40 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KCNH7Q9NS40 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KCNH7Q9NS40 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KCNH7Q9NS40 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KCNH7Q9NS40 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNH7Q9NS40 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KCNH7Q9NS40 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KCNH7Q9NS40 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KCNH7Q9NS40 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNH7Q9NS40 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNH7Q9NS40 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KCNH7Q9NS40 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KCNH7Q9NS40 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KCNH7Q9NS40 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNH7Q9NS40 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KCNH7Q9NS40 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KCNH7Q9NS40 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH7Q9NS40 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH7Q9NS40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNH7Q9NS40 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNH7Q9NS40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNH7Q9NS40 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNH7Q9NS40 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH7Q9NS40 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH7Q9NS40 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH7Q9NS40 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNH7Q9NS40 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNH7Q9NS40 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNH7Q9NS40 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNH7Q9NS40 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KCNH7Q9NS40 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNH7Q9NS40 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNH7Q9NS40 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNH7Q9NS40 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNH7Q9NS40 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNH7Q9NS40 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNH7Q9NS40 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNH7Q9NS40 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNH7Q9NS40 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNH7Q9NS40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNH7Q9NS40 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNH7Q9NS40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNH7Q9NS40 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KCNH7Q9NS40 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KCNH7Q9NS40 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KCNH7Q9NS40 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KCNH7Q9NS40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNH7Q9NS40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNH7Q9NS40 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNH7Q9NS40 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNH7Q9NS40 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KCNH7Q9NS40 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KCNH7Q9NS40 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KCNH7Q9NS40 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KCNH7Q9NS40 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KCNH7Q9NS40 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KCNH7Q9NS40 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KCNH7Q9NS40 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KCNH7Q9NS40 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KCNH7Q9NS40 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KCNH7Q9NS40 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KCNH7Q9NS40 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KCNH7Q9NS40 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KCNH7Q9NS40 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KCNH7Q9NS40 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KCNH7Q9NS40 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KCNH7Q9NS40 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KCNH7Q9NS40 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
KCNH7Q9NS40 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms