Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDC5

JPH1, Junctophilin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH1Q9HDC5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
JPH1Q9HDC5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
JPH1Q9HDC5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH1Q9HDC5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH1Q9HDC5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
JPH1Q9HDC5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
JPH1Q9HDC5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH1Q9HDC5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
JPH1Q9HDC5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
JPH1Q9HDC5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
JPH1Q9HDC5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
JPH1Q9HDC5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
JPH1Q9HDC5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
JPH1Q9HDC5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
JPH1Q9HDC5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
JPH1Q9HDC5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
JPH1Q9HDC5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
JPH1Q9HDC5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
JPH1Q9HDC5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
JPH1Q9HDC5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
JPH1Q9HDC5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
JPH1Q9HDC5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
JPH1Q9HDC5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
JPH1Q9HDC5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
JPH1Q9HDC5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
JPH1Q9HDC5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
JPH1Q9HDC5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
JPH1Q9HDC5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
JPH1Q9HDC5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
JPH1Q9HDC5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
JPH1Q9HDC5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
JPH1Q9HDC5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
JPH1Q9HDC5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
JPH1Q9HDC5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
JPH1Q9HDC5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
JPH1Q9HDC5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
JPH1Q9HDC5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
JPH1Q9HDC5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
JPH1Q9HDC5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
JPH1Q9HDC5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
JPH1Q9HDC5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
JPH1Q9HDC5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
JPH1Q9HDC5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
JPH1Q9HDC5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
JPH1Q9HDC5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
JPH1Q9HDC5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
JPH1Q9HDC5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
JPH1Q9HDC5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
JPH1Q9HDC5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
JPH1Q9HDC5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
JPH1Q9HDC5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
JPH1Q9HDC5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
JPH1Q9HDC5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
JPH1Q9HDC5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
JPH1Q9HDC5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
JPH1Q9HDC5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
JPH1Q9HDC5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
JPH1Q9HDC5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
JPH1Q9HDC5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
JPH1Q9HDC5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
JPH1Q9HDC5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
JPH1Q9HDC5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
JPH1Q9HDC5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
JPH1Q9HDC5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
JPH1Q9HDC5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
JPH1Q9HDC5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
JPH1Q9HDC5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
JPH1Q9HDC5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
JPH1Q9HDC5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
JPH1Q9HDC5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
JPH1Q9HDC5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
JPH1Q9HDC5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
JPH1Q9HDC5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
JPH1Q9HDC5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
JPH1Q9HDC5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
JPH1Q9HDC5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
JPH1Q9HDC5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
JPH1Q9HDC5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
JPH1Q9HDC5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
JPH1Q9HDC5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
JPH1Q9HDC5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
JPH1Q9HDC5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
JPH1Q9HDC5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
JPH1Q9HDC5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
JPH1Q9HDC5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
JPH1Q9HDC5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
JPH1Q9HDC5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
JPH1Q9HDC5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
JPH1Q9HDC5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
JPH1Q9HDC5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
JPH1Q9HDC5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
JPH1Q9HDC5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
JPH1Q9HDC5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
JPH1Q9HDC5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
JPH1Q9HDC5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
JPH1Q9HDC5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
JPH1Q9HDC5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
JPH1Q9HDC5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
JPH1Q9HDC5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
JPH1Q9HDC5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms