Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC23

PROK2, Prokineticin-2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK2Q9HC23 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PROK2Q9HC23 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PROK2Q9HC23 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PROK2Q9HC23 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PROK2Q9HC23 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PROK2Q9HC23 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PROK2Q9HC23 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PROK2Q9HC23 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PROK2Q9HC23 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PROK2Q9HC23 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PROK2Q9HC23 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PROK2Q9HC23 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PROK2Q9HC23 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PROK2Q9HC23 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PROK2Q9HC23 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PROK2Q9HC23 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PROK2Q9HC23 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PROK2Q9HC23 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PROK2Q9HC23 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PROK2Q9HC23 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROK2Q9HC23 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROK2Q9HC23 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PROK2Q9HC23 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PROK2Q9HC23 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PROK2Q9HC23 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PROK2Q9HC23 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PROK2Q9HC23 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PROK2Q9HC23 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROK2Q9HC23 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROK2Q9HC23 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROK2Q9HC23 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROK2Q9HC23 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROK2Q9HC23 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROK2Q9HC23 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROK2Q9HC23 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROK2Q9HC23 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PROK2Q9HC23 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PROK2Q9HC23 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROK2Q9HC23 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROK2Q9HC23 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PROK2Q9HC23 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PROK2Q9HC23 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PROK2Q9HC23 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PROK2Q9HC23 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PROK2Q9HC23 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROK2Q9HC23 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PROK2Q9HC23 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PROK2Q9HC23 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROK2Q9HC23 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROK2Q9HC23 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PROK2Q9HC23 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROK2Q9HC23 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PROK2Q9HC23 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PROK2Q9HC23 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PROK2Q9HC23 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PROK2Q9HC23 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PROK2Q9HC23 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PROK2Q9HC23 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PROK2Q9HC23 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PROK2Q9HC23 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PROK2Q9HC23 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PROK2Q9HC23 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PROK2Q9HC23 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROK2Q9HC23 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROK2Q9HC23 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROK2Q9HC23 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROK2Q9HC23 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PROK2Q9HC23 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROK2Q9HC23 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PROK2Q9HC23 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PROK2Q9HC23 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PROK2Q9HC23 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PROK2Q9HC23 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PROK2Q9HC23 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PROK2Q9HC23 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PROK2Q9HC23 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PROK2Q9HC23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROK2Q9HC23 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROK2Q9HC23 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROK2Q9HC23 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROK2Q9HC23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PROK2Q9HC23 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROK2Q9HC23 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROK2Q9HC23 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROK2Q9HC23 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROK2Q9HC23 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PROK2Q9HC23 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PROK2Q9HC23 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PROK2Q9HC23 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PROK2Q9HC23 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PROK2Q9HC23 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PROK2Q9HC23 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PROK2Q9HC23 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PROK2Q9HC23 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PROK2Q9HC23 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PROK2Q9HC23 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PROK2Q9HC23 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROK2Q9HC23 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PROK2Q9HC23 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PROK2Q9HC23 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms