Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0A8

COMMD4, COMM domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4Q9H0A8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COMMD4Q9H0A8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COMMD4Q9H0A8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COMMD4Q9H0A8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COMMD4Q9H0A8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COMMD4Q9H0A8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COMMD4Q9H0A8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COMMD4Q9H0A8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COMMD4Q9H0A8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMMD4Q9H0A8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COMMD4Q9H0A8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COMMD4Q9H0A8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COMMD4Q9H0A8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COMMD4Q9H0A8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COMMD4Q9H0A8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COMMD4Q9H0A8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COMMD4Q9H0A8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COMMD4Q9H0A8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COMMD4Q9H0A8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COMMD4Q9H0A8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COMMD4Q9H0A8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COMMD4Q9H0A8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COMMD4Q9H0A8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COMMD4Q9H0A8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COMMD4Q9H0A8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COMMD4Q9H0A8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COMMD4Q9H0A8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COMMD4Q9H0A8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COMMD4Q9H0A8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COMMD4Q9H0A8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COMMD4Q9H0A8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COMMD4Q9H0A8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COMMD4Q9H0A8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COMMD4Q9H0A8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMMD4Q9H0A8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COMMD4Q9H0A8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COMMD4Q9H0A8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COMMD4Q9H0A8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COMMD4Q9H0A8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD4Q9H0A8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD4Q9H0A8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COMMD4Q9H0A8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COMMD4Q9H0A8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COMMD4Q9H0A8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COMMD4Q9H0A8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COMMD4Q9H0A8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COMMD4Q9H0A8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COMMD4Q9H0A8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COMMD4Q9H0A8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COMMD4Q9H0A8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COMMD4Q9H0A8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COMMD4Q9H0A8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COMMD4Q9H0A8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COMMD4Q9H0A8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COMMD4Q9H0A8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COMMD4Q9H0A8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COMMD4Q9H0A8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COMMD4Q9H0A8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COMMD4Q9H0A8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COMMD4Q9H0A8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COMMD4Q9H0A8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COMMD4Q9H0A8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD4Q9H0A8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD4Q9H0A8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD4Q9H0A8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD4Q9H0A8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COMMD4Q9H0A8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD4Q9H0A8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD4Q9H0A8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD4Q9H0A8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COMMD4Q9H0A8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD4Q9H0A8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COMMD4Q9H0A8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COMMD4Q9H0A8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD4Q9H0A8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COMMD4Q9H0A8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD4Q9H0A8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COMMD4Q9H0A8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD4Q9H0A8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD4Q9H0A8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD4Q9H0A8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD4Q9H0A8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD4Q9H0A8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD4Q9H0A8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD4Q9H0A8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD4Q9H0A8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD4Q9H0A8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD4Q9H0A8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD4Q9H0A8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD4Q9H0A8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COMMD4Q9H0A8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COMMD4Q9H0A8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COMMD4Q9H0A8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD4Q9H0A8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD4Q9H0A8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COMMD4Q9H0A8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD4Q9H0A8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COMMD4Q9H0A8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD4Q9H0A8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD4Q9H0A8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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