Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TRIM34Q9BYJ4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
TRIM34Q9BYJ4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TRIM34Q9BYJ4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TRIM34Q9BYJ4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TRIM34Q9BYJ4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM34Q9BYJ4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM34Q9BYJ4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TRIM34Q9BYJ4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRIM34Q9BYJ4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TRIM34Q9BYJ4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TRIM34Q9BYJ4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TRIM34Q9BYJ4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TRIM34Q9BYJ4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM34Q9BYJ4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRIM34Q9BYJ4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRIM34Q9BYJ4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM34Q9BYJ4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM34Q9BYJ4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM34Q9BYJ4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM34Q9BYJ4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM34Q9BYJ4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM34Q9BYJ4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM34Q9BYJ4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM34Q9BYJ4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM34Q9BYJ4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM34Q9BYJ4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM34Q9BYJ4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM34Q9BYJ4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM34Q9BYJ4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM34Q9BYJ4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRIM34Q9BYJ4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM34Q9BYJ4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM34Q9BYJ4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TRIM34Q9BYJ4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM34Q9BYJ4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM34Q9BYJ4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM34Q9BYJ4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM34Q9BYJ4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM34Q9BYJ4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM34Q9BYJ4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM34Q9BYJ4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM34Q9BYJ4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM34Q9BYJ4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM34Q9BYJ4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM34Q9BYJ4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM34Q9BYJ4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM34Q9BYJ4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM34Q9BYJ4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM34Q9BYJ4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM34Q9BYJ4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM34Q9BYJ4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM34Q9BYJ4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM34Q9BYJ4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM34Q9BYJ4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM34Q9BYJ4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM34Q9BYJ4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM34Q9BYJ4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM34Q9BYJ4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM34Q9BYJ4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM34Q9BYJ4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIM34Q9BYJ4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM34Q9BYJ4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM34Q9BYJ4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRIM34Q9BYJ4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM34Q9BYJ4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM34Q9BYJ4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM34Q9BYJ4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM34Q9BYJ4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM34Q9BYJ4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM34Q9BYJ4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM34Q9BYJ4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM34Q9BYJ4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM34Q9BYJ4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM34Q9BYJ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM34Q9BYJ4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM34Q9BYJ4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM34Q9BYJ4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM34Q9BYJ4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM34Q9BYJ4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM34Q9BYJ4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM34Q9BYJ4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM34Q9BYJ4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM34Q9BYJ4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM34Q9BYJ4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM34Q9BYJ4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM34Q9BYJ4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRIM34Q9BYJ4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRIM34Q9BYJ4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRIM34Q9BYJ4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRIM34Q9BYJ4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TRIM34Q9BYJ4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRIM34Q9BYJ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRIM34Q9BYJ4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRIM34Q9BYJ4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRIM34Q9BYJ4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM34Q9BYJ4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM34Q9BYJ4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM34Q9BYJ4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM34Q9BYJ4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms