Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT92

TCHP, Trichoplein keratin filament-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHPQ9BT92 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TCHPQ9BT92 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TCHPQ9BT92 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TCHPQ9BT92 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TCHPQ9BT92 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TCHPQ9BT92 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TCHPQ9BT92 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TCHPQ9BT92 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TCHPQ9BT92 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TCHPQ9BT92 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TCHPQ9BT92 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TCHPQ9BT92 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TCHPQ9BT92 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TCHPQ9BT92 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TCHPQ9BT92 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TCHPQ9BT92 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TCHPQ9BT92 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TCHPQ9BT92 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TCHPQ9BT92 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TCHPQ9BT92 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TCHPQ9BT92 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TCHPQ9BT92 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TCHPQ9BT92 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TCHPQ9BT92 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TCHPQ9BT92 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCHPQ9BT92 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TCHPQ9BT92 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TCHPQ9BT92 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TCHPQ9BT92 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TCHPQ9BT92 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TCHPQ9BT92 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TCHPQ9BT92 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TCHPQ9BT92 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TCHPQ9BT92 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TCHPQ9BT92 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TCHPQ9BT92 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TCHPQ9BT92 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TCHPQ9BT92 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TCHPQ9BT92 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TCHPQ9BT92 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TCHPQ9BT92 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TCHPQ9BT92 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TCHPQ9BT92 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TCHPQ9BT92 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TCHPQ9BT92 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TCHPQ9BT92 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TCHPQ9BT92 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TCHPQ9BT92 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TCHPQ9BT92 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TCHPQ9BT92 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TCHPQ9BT92 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TCHPQ9BT92 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TCHPQ9BT92 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TCHPQ9BT92 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TCHPQ9BT92 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TCHPQ9BT92 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TCHPQ9BT92 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TCHPQ9BT92 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TCHPQ9BT92 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TCHPQ9BT92 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TCHPQ9BT92 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TCHPQ9BT92 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TCHPQ9BT92 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TCHPQ9BT92 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TCHPQ9BT92 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TCHPQ9BT92 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TCHPQ9BT92 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TCHPQ9BT92 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TCHPQ9BT92 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TCHPQ9BT92 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TCHPQ9BT92 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCHPQ9BT92 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCHPQ9BT92 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCHPQ9BT92 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TCHPQ9BT92 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TCHPQ9BT92 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TCHPQ9BT92 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TCHPQ9BT92 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TCHPQ9BT92 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TCHPQ9BT92 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TCHPQ9BT92 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TCHPQ9BT92 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TCHPQ9BT92 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TCHPQ9BT92 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCHPQ9BT92 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCHPQ9BT92 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCHPQ9BT92 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCHPQ9BT92 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TCHPQ9BT92 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TCHPQ9BT92 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCHPQ9BT92 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TCHPQ9BT92 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TCHPQ9BT92 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCHPQ9BT92 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCHPQ9BT92 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCHPQ9BT92 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TCHPQ9BT92 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TCHPQ9BT92 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TCHPQ9BT92 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TCHPQ9BT92 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms