Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCM2Q9BSQ5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCM2Q9BSQ5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CCM2Q9BSQ5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCM2Q9BSQ5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCM2Q9BSQ5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCM2Q9BSQ5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCM2Q9BSQ5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCM2Q9BSQ5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCM2Q9BSQ5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCM2Q9BSQ5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCM2Q9BSQ5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCM2Q9BSQ5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCM2Q9BSQ5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCM2Q9BSQ5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCM2Q9BSQ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCM2Q9BSQ5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCM2Q9BSQ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCM2Q9BSQ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCM2Q9BSQ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCM2Q9BSQ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCM2Q9BSQ5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCM2Q9BSQ5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCM2Q9BSQ5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCM2Q9BSQ5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCM2Q9BSQ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCM2Q9BSQ5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCM2Q9BSQ5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCM2Q9BSQ5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCM2Q9BSQ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCM2Q9BSQ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCM2Q9BSQ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCM2Q9BSQ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCM2Q9BSQ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCM2Q9BSQ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCM2Q9BSQ5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCM2Q9BSQ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCM2Q9BSQ5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCM2Q9BSQ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCM2Q9BSQ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCM2Q9BSQ5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCM2Q9BSQ5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCM2Q9BSQ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCM2Q9BSQ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCM2Q9BSQ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCM2Q9BSQ5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCM2Q9BSQ5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCM2Q9BSQ5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCM2Q9BSQ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCM2Q9BSQ5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCM2Q9BSQ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCM2Q9BSQ5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCM2Q9BSQ5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCM2Q9BSQ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCM2Q9BSQ5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCM2Q9BSQ5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCM2Q9BSQ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCM2Q9BSQ5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCM2Q9BSQ5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCM2Q9BSQ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCM2Q9BSQ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCM2Q9BSQ5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCM2Q9BSQ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCM2Q9BSQ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCM2Q9BSQ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCM2Q9BSQ5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCM2Q9BSQ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCM2Q9BSQ5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCM2Q9BSQ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCM2Q9BSQ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCM2Q9BSQ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCM2Q9BSQ5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCM2Q9BSQ5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCM2Q9BSQ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCM2Q9BSQ5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCM2Q9BSQ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCM2Q9BSQ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCM2Q9BSQ5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCM2Q9BSQ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCM2Q9BSQ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCM2Q9BSQ5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCM2Q9BSQ5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCM2Q9BSQ5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCM2Q9BSQ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCM2Q9BSQ5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCM2Q9BSQ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCM2Q9BSQ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCM2Q9BSQ5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCM2Q9BSQ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCM2Q9BSQ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCM2Q9BSQ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCM2Q9BSQ5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCM2Q9BSQ5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCM2Q9BSQ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCM2Q9BSQ5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCM2Q9BSQ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCM2Q9BSQ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCM2Q9BSQ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCM2Q9BSQ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCM2Q9BSQ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms