Protein–RNA interactions for Protein: Q99447

PCYT2, Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT2Q99447 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PCYT2Q99447 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PCYT2Q99447 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PCYT2Q99447 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PCYT2Q99447 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
PCYT2Q99447 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PCYT2Q99447 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PCYT2Q99447 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PCYT2Q99447 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCYT2Q99447 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCYT2Q99447 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCYT2Q99447 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCYT2Q99447 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PCYT2Q99447 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCYT2Q99447 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCYT2Q99447 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCYT2Q99447 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCYT2Q99447 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCYT2Q99447 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PCYT2Q99447 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PCYT2Q99447 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCYT2Q99447 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCYT2Q99447 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PCYT2Q99447 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PCYT2Q99447 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCYT2Q99447 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCYT2Q99447 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCYT2Q99447 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PCYT2Q99447 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCYT2Q99447 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCYT2Q99447 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCYT2Q99447 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCYT2Q99447 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCYT2Q99447 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCYT2Q99447 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCYT2Q99447 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCYT2Q99447 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCYT2Q99447 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PCYT2Q99447 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCYT2Q99447 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCYT2Q99447 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCYT2Q99447 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCYT2Q99447 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCYT2Q99447 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCYT2Q99447 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PCYT2Q99447 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCYT2Q99447 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCYT2Q99447 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PCYT2Q99447 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PCYT2Q99447 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCYT2Q99447 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCYT2Q99447 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCYT2Q99447 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCYT2Q99447 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCYT2Q99447 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCYT2Q99447 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCYT2Q99447 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCYT2Q99447 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCYT2Q99447 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PCYT2Q99447 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PCYT2Q99447 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCYT2Q99447 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCYT2Q99447 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PCYT2Q99447 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PCYT2Q99447 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PCYT2Q99447 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PCYT2Q99447 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PCYT2Q99447 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PCYT2Q99447 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCYT2Q99447 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCYT2Q99447 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PCYT2Q99447 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PCYT2Q99447 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PCYT2Q99447 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PCYT2Q99447 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCYT2Q99447 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCYT2Q99447 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCYT2Q99447 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCYT2Q99447 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCYT2Q99447 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCYT2Q99447 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCYT2Q99447 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCYT2Q99447 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCYT2Q99447 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCYT2Q99447 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCYT2Q99447 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCYT2Q99447 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCYT2Q99447 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCYT2Q99447 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCYT2Q99447 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCYT2Q99447 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCYT2Q99447 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PCYT2Q99447 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCYT2Q99447 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCYT2Q99447 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCYT2Q99447 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PCYT2Q99447 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PCYT2Q99447 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PCYT2Q99447 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PCYT2Q99447 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms