Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNN2Q99439 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNN2Q99439 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNN2Q99439 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNN2Q99439 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNN2Q99439 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CNN2Q99439 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNN2Q99439 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNN2Q99439 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNN2Q99439 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNN2Q99439 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNN2Q99439 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNN2Q99439 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNN2Q99439 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNN2Q99439 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNN2Q99439 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNN2Q99439 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNN2Q99439 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNN2Q99439 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNN2Q99439 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNN2Q99439 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNN2Q99439 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNN2Q99439 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNN2Q99439 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNN2Q99439 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNN2Q99439 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNN2Q99439 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNN2Q99439 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNN2Q99439 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNN2Q99439 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNN2Q99439 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNN2Q99439 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNN2Q99439 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNN2Q99439 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNN2Q99439 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNN2Q99439 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNN2Q99439 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNN2Q99439 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNN2Q99439 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNN2Q99439 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNN2Q99439 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNN2Q99439 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNN2Q99439 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNN2Q99439 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNN2Q99439 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNN2Q99439 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNN2Q99439 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNN2Q99439 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNN2Q99439 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNN2Q99439 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNN2Q99439 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNN2Q99439 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNN2Q99439 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNN2Q99439 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNN2Q99439 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNN2Q99439 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNN2Q99439 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNN2Q99439 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNN2Q99439 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNN2Q99439 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNN2Q99439 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNN2Q99439 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNN2Q99439 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNN2Q99439 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNN2Q99439 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNN2Q99439 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNN2Q99439 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNN2Q99439 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNN2Q99439 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNN2Q99439 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNN2Q99439 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNN2Q99439 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNN2Q99439 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNN2Q99439 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNN2Q99439 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNN2Q99439 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNN2Q99439 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNN2Q99439 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNN2Q99439 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNN2Q99439 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNN2Q99439 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNN2Q99439 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CNN2Q99439 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNN2Q99439 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNN2Q99439 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNN2Q99439 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNN2Q99439 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNN2Q99439 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNN2Q99439 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNN2Q99439 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNN2Q99439 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNN2Q99439 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNN2Q99439 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNN2Q99439 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNN2Q99439 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNN2Q99439 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNN2Q99439 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNN2Q99439 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNN2Q99439 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNN2Q99439 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms