Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE3

ATAD5, ATPase family AAA domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD5Q96QE3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ATAD5Q96QE3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ATAD5Q96QE3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ATAD5Q96QE3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD5Q96QE3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ATAD5Q96QE3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ATAD5Q96QE3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ATAD5Q96QE3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
ATAD5Q96QE3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATAD5Q96QE3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATAD5Q96QE3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATAD5Q96QE3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATAD5Q96QE3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATAD5Q96QE3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATAD5Q96QE3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATAD5Q96QE3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATAD5Q96QE3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATAD5Q96QE3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ATAD5Q96QE3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATAD5Q96QE3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ATAD5Q96QE3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATAD5Q96QE3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATAD5Q96QE3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATAD5Q96QE3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATAD5Q96QE3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATAD5Q96QE3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATAD5Q96QE3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATAD5Q96QE3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATAD5Q96QE3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ATAD5Q96QE3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ATAD5Q96QE3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ATAD5Q96QE3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ATAD5Q96QE3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ATAD5Q96QE3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATAD5Q96QE3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATAD5Q96QE3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATAD5Q96QE3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ATAD5Q96QE3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.42
ATAD5Q96QE3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATAD5Q96QE3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATAD5Q96QE3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ATAD5Q96QE3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD5Q96QE3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD5Q96QE3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATAD5Q96QE3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATAD5Q96QE3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ATAD5Q96QE3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ATAD5Q96QE3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATAD5Q96QE3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATAD5Q96QE3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ATAD5Q96QE3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ATAD5Q96QE3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATAD5Q96QE3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ATAD5Q96QE3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATAD5Q96QE3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATAD5Q96QE3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATAD5Q96QE3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATAD5Q96QE3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATAD5Q96QE3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATAD5Q96QE3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATAD5Q96QE3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATAD5Q96QE3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATAD5Q96QE3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATAD5Q96QE3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATAD5Q96QE3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATAD5Q96QE3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATAD5Q96QE3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATAD5Q96QE3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATAD5Q96QE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATAD5Q96QE3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATAD5Q96QE3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATAD5Q96QE3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATAD5Q96QE3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATAD5Q96QE3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATAD5Q96QE3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATAD5Q96QE3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATAD5Q96QE3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATAD5Q96QE3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATAD5Q96QE3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATAD5Q96QE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ATAD5Q96QE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ATAD5Q96QE3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATAD5Q96QE3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATAD5Q96QE3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ATAD5Q96QE3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATAD5Q96QE3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATAD5Q96QE3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATAD5Q96QE3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ATAD5Q96QE3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ATAD5Q96QE3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATAD5Q96QE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms