Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC7Q96QD5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DEPDC7Q96QD5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DEPDC7Q96QD5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DEPDC7Q96QD5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DEPDC7Q96QD5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DEPDC7Q96QD5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DEPDC7Q96QD5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
DEPDC7Q96QD5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DEPDC7Q96QD5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DEPDC7Q96QD5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
DEPDC7Q96QD5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DEPDC7Q96QD5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DEPDC7Q96QD5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DEPDC7Q96QD5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DEPDC7Q96QD5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DEPDC7Q96QD5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DEPDC7Q96QD5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DEPDC7Q96QD5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DEPDC7Q96QD5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
DEPDC7Q96QD5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DEPDC7Q96QD5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DEPDC7Q96QD5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DEPDC7Q96QD5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DEPDC7Q96QD5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DEPDC7Q96QD5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DEPDC7Q96QD5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
DEPDC7Q96QD5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DEPDC7Q96QD5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DEPDC7Q96QD5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DEPDC7Q96QD5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DEPDC7Q96QD5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DEPDC7Q96QD5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DEPDC7Q96QD5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
DEPDC7Q96QD5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
DEPDC7Q96QD5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DEPDC7Q96QD5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DEPDC7Q96QD5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DEPDC7Q96QD5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DEPDC7Q96QD5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
DEPDC7Q96QD5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DEPDC7Q96QD5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DEPDC7Q96QD5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DEPDC7Q96QD5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DEPDC7Q96QD5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DEPDC7Q96QD5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DEPDC7Q96QD5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DEPDC7Q96QD5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DEPDC7Q96QD5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DEPDC7Q96QD5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DEPDC7Q96QD5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DEPDC7Q96QD5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DEPDC7Q96QD5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DEPDC7Q96QD5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DEPDC7Q96QD5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DEPDC7Q96QD5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DEPDC7Q96QD5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DEPDC7Q96QD5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DEPDC7Q96QD5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DEPDC7Q96QD5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DEPDC7Q96QD5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DEPDC7Q96QD5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DEPDC7Q96QD5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DEPDC7Q96QD5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DEPDC7Q96QD5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DEPDC7Q96QD5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC7Q96QD5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC7Q96QD5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC7Q96QD5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC7Q96QD5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DEPDC7Q96QD5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DEPDC7Q96QD5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DEPDC7Q96QD5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DEPDC7Q96QD5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DEPDC7Q96QD5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DEPDC7Q96QD5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DEPDC7Q96QD5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DEPDC7Q96QD5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DEPDC7Q96QD5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DEPDC7Q96QD5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DEPDC7Q96QD5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEPDC7Q96QD5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DEPDC7Q96QD5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DEPDC7Q96QD5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEPDC7Q96QD5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEPDC7Q96QD5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEPDC7Q96QD5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DEPDC7Q96QD5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DEPDC7Q96QD5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DEPDC7Q96QD5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DEPDC7Q96QD5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DEPDC7Q96QD5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DEPDC7Q96QD5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DEPDC7Q96QD5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DEPDC7Q96QD5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DEPDC7Q96QD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DEPDC7Q96QD5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DEPDC7Q96QD5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DEPDC7Q96QD5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DEPDC7Q96QD5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms