Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GATA6Q92908 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GATA6Q92908 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GATA6Q92908 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GATA6Q92908 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GATA6Q92908 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GATA6Q92908 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GATA6Q92908 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GATA6Q92908 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GATA6Q92908 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GATA6Q92908 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GATA6Q92908 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GATA6Q92908 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GATA6Q92908 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GATA6Q92908 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GATA6Q92908 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GATA6Q92908 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GATA6Q92908 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GATA6Q92908 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GATA6Q92908 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GATA6Q92908 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GATA6Q92908 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GATA6Q92908 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GATA6Q92908 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GATA6Q92908 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GATA6Q92908 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GATA6Q92908 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GATA6Q92908 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GATA6Q92908 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GATA6Q92908 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GATA6Q92908 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GATA6Q92908 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GATA6Q92908 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GATA6Q92908 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GATA6Q92908 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GATA6Q92908 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GATA6Q92908 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GATA6Q92908 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GATA6Q92908 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GATA6Q92908 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GATA6Q92908 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GATA6Q92908 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GATA6Q92908 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GATA6Q92908 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GATA6Q92908 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GATA6Q92908 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GATA6Q92908 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GATA6Q92908 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GATA6Q92908 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GATA6Q92908 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GATA6Q92908 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GATA6Q92908 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GATA6Q92908 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GATA6Q92908 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GATA6Q92908 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GATA6Q92908 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GATA6Q92908 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GATA6Q92908 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GATA6Q92908 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GATA6Q92908 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GATA6Q92908 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GATA6Q92908 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GATA6Q92908 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GATA6Q92908 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GATA6Q92908 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GATA6Q92908 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GATA6Q92908 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GATA6Q92908 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GATA6Q92908 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GATA6Q92908 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GATA6Q92908 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GATA6Q92908 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GATA6Q92908 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GATA6Q92908 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GATA6Q92908 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GATA6Q92908 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GATA6Q92908 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GATA6Q92908 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GATA6Q92908 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GATA6Q92908 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GATA6Q92908 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GATA6Q92908 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GATA6Q92908 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GATA6Q92908 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GATA6Q92908 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GATA6Q92908 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GATA6Q92908 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GATA6Q92908 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GATA6Q92908 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GATA6Q92908 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GATA6Q92908 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GATA6Q92908 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GATA6Q92908 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GATA6Q92908 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GATA6Q92908 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GATA6Q92908 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GATA6Q92908 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GATA6Q92908 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GATA6Q92908 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GATA6Q92908 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms