Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
DNERQ8NFT8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
DNERQ8NFT8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
DNERQ8NFT8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
DNERQ8NFT8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
DNERQ8NFT8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
DNERQ8NFT8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
DNERQ8NFT8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
DNERQ8NFT8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
DNERQ8NFT8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DNERQ8NFT8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
DNERQ8NFT8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DNERQ8NFT8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
DNERQ8NFT8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DNERQ8NFT8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DNERQ8NFT8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNERQ8NFT8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DNERQ8NFT8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DNERQ8NFT8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DNERQ8NFT8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DNERQ8NFT8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DNERQ8NFT8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DNERQ8NFT8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DNERQ8NFT8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DNERQ8NFT8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DNERQ8NFT8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
DNERQ8NFT8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DNERQ8NFT8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
DNERQ8NFT8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
DNERQ8NFT8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
DNERQ8NFT8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DNERQ8NFT8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
DNERQ8NFT8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNERQ8NFT8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DNERQ8NFT8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DNERQ8NFT8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
DNERQ8NFT8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
DNERQ8NFT8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35■■■■□ 3.19
DNERQ8NFT8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
DNERQ8NFT8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
DNERQ8NFT8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
DNERQ8NFT8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
DNERQ8NFT8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
DNERQ8NFT8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
DNERQ8NFT8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DNERQ8NFT8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
DNERQ8NFT8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DNERQ8NFT8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DNERQ8NFT8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DNERQ8NFT8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DNERQ8NFT8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DNERQ8NFT8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DNERQ8NFT8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DNERQ8NFT8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
DNERQ8NFT8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNERQ8NFT8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DNERQ8NFT8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DNERQ8NFT8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DNERQ8NFT8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNERQ8NFT8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DNERQ8NFT8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DNERQ8NFT8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNERQ8NFT8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNERQ8NFT8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNERQ8NFT8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
DNERQ8NFT8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DNERQ8NFT8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DNERQ8NFT8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNERQ8NFT8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DNERQ8NFT8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DNERQ8NFT8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNERQ8NFT8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNERQ8NFT8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNERQ8NFT8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNERQ8NFT8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
DNERQ8NFT8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNERQ8NFT8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNERQ8NFT8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNERQ8NFT8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNERQ8NFT8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNERQ8NFT8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DNERQ8NFT8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DNERQ8NFT8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DNERQ8NFT8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DNERQ8NFT8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNERQ8NFT8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNERQ8NFT8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DNERQ8NFT8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DNERQ8NFT8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DNERQ8NFT8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
DNERQ8NFT8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNERQ8NFT8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNERQ8NFT8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNERQ8NFT8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DNERQ8NFT8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DNERQ8NFT8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DNERQ8NFT8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNERQ8NFT8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DNERQ8NFT8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DNERQ8NFT8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms