Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
KBTBD3Q8NAB2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
KBTBD3Q8NAB2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
KBTBD3Q8NAB2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
KBTBD3Q8NAB2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
KBTBD3Q8NAB2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
KBTBD3Q8NAB2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
KBTBD3Q8NAB2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
KBTBD3Q8NAB2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
KBTBD3Q8NAB2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KBTBD3Q8NAB2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
KBTBD3Q8NAB2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KBTBD3Q8NAB2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KBTBD3Q8NAB2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
KBTBD3Q8NAB2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
KBTBD3Q8NAB2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
KBTBD3Q8NAB2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
KBTBD3Q8NAB2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
KBTBD3Q8NAB2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
KBTBD3Q8NAB2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
KBTBD3Q8NAB2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KBTBD3Q8NAB2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KBTBD3Q8NAB2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KBTBD3Q8NAB2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KBTBD3Q8NAB2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KBTBD3Q8NAB2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
KBTBD3Q8NAB2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KBTBD3Q8NAB2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KBTBD3Q8NAB2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KBTBD3Q8NAB2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KBTBD3Q8NAB2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KBTBD3Q8NAB2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KBTBD3Q8NAB2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KBTBD3Q8NAB2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KBTBD3Q8NAB2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KBTBD3Q8NAB2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KBTBD3Q8NAB2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KBTBD3Q8NAB2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KBTBD3Q8NAB2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KBTBD3Q8NAB2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KBTBD3Q8NAB2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KBTBD3Q8NAB2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KBTBD3Q8NAB2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KBTBD3Q8NAB2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KBTBD3Q8NAB2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KBTBD3Q8NAB2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KBTBD3Q8NAB2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KBTBD3Q8NAB2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
KBTBD3Q8NAB2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KBTBD3Q8NAB2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
KBTBD3Q8NAB2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KBTBD3Q8NAB2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KBTBD3Q8NAB2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KBTBD3Q8NAB2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KBTBD3Q8NAB2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KBTBD3Q8NAB2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KBTBD3Q8NAB2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KBTBD3Q8NAB2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KBTBD3Q8NAB2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KBTBD3Q8NAB2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KBTBD3Q8NAB2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KBTBD3Q8NAB2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KBTBD3Q8NAB2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
KBTBD3Q8NAB2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KBTBD3Q8NAB2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KBTBD3Q8NAB2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KBTBD3Q8NAB2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KBTBD3Q8NAB2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KBTBD3Q8NAB2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KBTBD3Q8NAB2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KBTBD3Q8NAB2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KBTBD3Q8NAB2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
KBTBD3Q8NAB2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KBTBD3Q8NAB2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KBTBD3Q8NAB2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KBTBD3Q8NAB2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KBTBD3Q8NAB2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KBTBD3Q8NAB2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KBTBD3Q8NAB2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KBTBD3Q8NAB2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KBTBD3Q8NAB2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KBTBD3Q8NAB2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KBTBD3Q8NAB2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
KBTBD3Q8NAB2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KBTBD3Q8NAB2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KBTBD3Q8NAB2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KBTBD3Q8NAB2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KBTBD3Q8NAB2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KBTBD3Q8NAB2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KBTBD3Q8NAB2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KBTBD3Q8NAB2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KBTBD3Q8NAB2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KBTBD3Q8NAB2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
KBTBD3Q8NAB2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KBTBD3Q8NAB2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KBTBD3Q8NAB2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KBTBD3Q8NAB2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms