Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.63■■■■■ 4.58
CNBD1Q8NA66 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CNBD1Q8NA66 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CNBD1Q8NA66 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CNBD1Q8NA66 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CNBD1Q8NA66 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CNBD1Q8NA66 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CNBD1Q8NA66 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
CNBD1Q8NA66 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CNBD1Q8NA66 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CNBD1Q8NA66 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CNBD1Q8NA66 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CNBD1Q8NA66 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CNBD1Q8NA66 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CNBD1Q8NA66 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CNBD1Q8NA66 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CNBD1Q8NA66 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CNBD1Q8NA66 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CNBD1Q8NA66 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CNBD1Q8NA66 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CNBD1Q8NA66 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CNBD1Q8NA66 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CNBD1Q8NA66 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CNBD1Q8NA66 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CNBD1Q8NA66 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CNBD1Q8NA66 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CNBD1Q8NA66 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CNBD1Q8NA66 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CNBD1Q8NA66 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CNBD1Q8NA66 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CNBD1Q8NA66 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CNBD1Q8NA66 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CNBD1Q8NA66 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CNBD1Q8NA66 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CNBD1Q8NA66 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CNBD1Q8NA66 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CNBD1Q8NA66 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CNBD1Q8NA66 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CNBD1Q8NA66 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CNBD1Q8NA66 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CNBD1Q8NA66 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CNBD1Q8NA66 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CNBD1Q8NA66 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CNBD1Q8NA66 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CNBD1Q8NA66 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CNBD1Q8NA66 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CNBD1Q8NA66 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CNBD1Q8NA66 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CNBD1Q8NA66 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CNBD1Q8NA66 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CNBD1Q8NA66 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CNBD1Q8NA66 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CNBD1Q8NA66 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CNBD1Q8NA66 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CNBD1Q8NA66 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CNBD1Q8NA66 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CNBD1Q8NA66 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CNBD1Q8NA66 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CNBD1Q8NA66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CNBD1Q8NA66 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CNBD1Q8NA66 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CNBD1Q8NA66 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CNBD1Q8NA66 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CNBD1Q8NA66 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CNBD1Q8NA66 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CNBD1Q8NA66 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CNBD1Q8NA66 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CNBD1Q8NA66 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CNBD1Q8NA66 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CNBD1Q8NA66 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CNBD1Q8NA66 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CNBD1Q8NA66 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CNBD1Q8NA66 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CNBD1Q8NA66 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CNBD1Q8NA66 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CNBD1Q8NA66 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CNBD1Q8NA66 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CNBD1Q8NA66 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CNBD1Q8NA66 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CNBD1Q8NA66 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CNBD1Q8NA66 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CNBD1Q8NA66 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CNBD1Q8NA66 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CNBD1Q8NA66 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CNBD1Q8NA66 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CNBD1Q8NA66 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CNBD1Q8NA66 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CNBD1Q8NA66 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CNBD1Q8NA66 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CNBD1Q8NA66 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CNBD1Q8NA66 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CNBD1Q8NA66 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CNBD1Q8NA66 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CNBD1Q8NA66 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CNBD1Q8NA66 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CNBD1Q8NA66 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CNBD1Q8NA66 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CNBD1Q8NA66 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CNBD1Q8NA66 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CNBD1Q8NA66 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms