Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLDN22Q8N7P3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLDN22Q8N7P3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLDN22Q8N7P3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLDN22Q8N7P3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLDN22Q8N7P3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CLDN22Q8N7P3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLDN22Q8N7P3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLDN22Q8N7P3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLDN22Q8N7P3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLDN22Q8N7P3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLDN22Q8N7P3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLDN22Q8N7P3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLDN22Q8N7P3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLDN22Q8N7P3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLDN22Q8N7P3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLDN22Q8N7P3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLDN22Q8N7P3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLDN22Q8N7P3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLDN22Q8N7P3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLDN22Q8N7P3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLDN22Q8N7P3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLDN22Q8N7P3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLDN22Q8N7P3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLDN22Q8N7P3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLDN22Q8N7P3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLDN22Q8N7P3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLDN22Q8N7P3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLDN22Q8N7P3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLDN22Q8N7P3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLDN22Q8N7P3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN22Q8N7P3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDN22Q8N7P3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN22Q8N7P3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN22Q8N7P3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN22Q8N7P3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLDN22Q8N7P3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN22Q8N7P3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLDN22Q8N7P3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLDN22Q8N7P3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN22Q8N7P3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN22Q8N7P3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN22Q8N7P3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN22Q8N7P3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN22Q8N7P3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN22Q8N7P3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLDN22Q8N7P3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN22Q8N7P3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLDN22Q8N7P3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN22Q8N7P3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN22Q8N7P3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN22Q8N7P3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN22Q8N7P3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN22Q8N7P3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN22Q8N7P3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN22Q8N7P3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN22Q8N7P3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN22Q8N7P3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN22Q8N7P3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN22Q8N7P3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN22Q8N7P3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN22Q8N7P3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN22Q8N7P3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN22Q8N7P3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN22Q8N7P3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLDN22Q8N7P3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN22Q8N7P3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN22Q8N7P3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN22Q8N7P3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN22Q8N7P3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN22Q8N7P3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDN22Q8N7P3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN22Q8N7P3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN22Q8N7P3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN22Q8N7P3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN22Q8N7P3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN22Q8N7P3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN22Q8N7P3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN22Q8N7P3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN22Q8N7P3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN22Q8N7P3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN22Q8N7P3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN22Q8N7P3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN22Q8N7P3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN22Q8N7P3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN22Q8N7P3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN22Q8N7P3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN22Q8N7P3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN22Q8N7P3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN22Q8N7P3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN22Q8N7P3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CLDN22Q8N7P3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLDN22Q8N7P3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLDN22Q8N7P3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN22Q8N7P3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN22Q8N7P3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN22Q8N7P3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN22Q8N7P3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN22Q8N7P3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN22Q8N7P3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms