Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ANKRD13CQ8N6S4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ANKRD13CQ8N6S4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ANKRD13CQ8N6S4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ANKRD13CQ8N6S4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ANKRD13CQ8N6S4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ANKRD13CQ8N6S4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ANKRD13CQ8N6S4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
ANKRD13CQ8N6S4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ANKRD13CQ8N6S4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ANKRD13CQ8N6S4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ANKRD13CQ8N6S4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ANKRD13CQ8N6S4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ANKRD13CQ8N6S4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ANKRD13CQ8N6S4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ANKRD13CQ8N6S4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ANKRD13CQ8N6S4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ANKRD13CQ8N6S4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ANKRD13CQ8N6S4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ANKRD13CQ8N6S4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ANKRD13CQ8N6S4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ANKRD13CQ8N6S4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ANKRD13CQ8N6S4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ANKRD13CQ8N6S4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ANKRD13CQ8N6S4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ANKRD13CQ8N6S4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ANKRD13CQ8N6S4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ANKRD13CQ8N6S4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ANKRD13CQ8N6S4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ANKRD13CQ8N6S4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ANKRD13CQ8N6S4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ANKRD13CQ8N6S4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ANKRD13CQ8N6S4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ANKRD13CQ8N6S4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ANKRD13CQ8N6S4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ANKRD13CQ8N6S4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ANKRD13CQ8N6S4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ANKRD13CQ8N6S4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ANKRD13CQ8N6S4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ANKRD13CQ8N6S4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ANKRD13CQ8N6S4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ANKRD13CQ8N6S4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ANKRD13CQ8N6S4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ANKRD13CQ8N6S4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ANKRD13CQ8N6S4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ANKRD13CQ8N6S4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ANKRD13CQ8N6S4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ANKRD13CQ8N6S4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ANKRD13CQ8N6S4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ANKRD13CQ8N6S4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ANKRD13CQ8N6S4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ANKRD13CQ8N6S4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ANKRD13CQ8N6S4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ANKRD13CQ8N6S4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ANKRD13CQ8N6S4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ANKRD13CQ8N6S4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ANKRD13CQ8N6S4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ANKRD13CQ8N6S4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ANKRD13CQ8N6S4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ANKRD13CQ8N6S4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ANKRD13CQ8N6S4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ANKRD13CQ8N6S4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ANKRD13CQ8N6S4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ANKRD13CQ8N6S4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ANKRD13CQ8N6S4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ANKRD13CQ8N6S4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ANKRD13CQ8N6S4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ANKRD13CQ8N6S4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ANKRD13CQ8N6S4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ANKRD13CQ8N6S4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ANKRD13CQ8N6S4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ANKRD13CQ8N6S4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ANKRD13CQ8N6S4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ANKRD13CQ8N6S4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ANKRD13CQ8N6S4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ANKRD13CQ8N6S4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ANKRD13CQ8N6S4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ANKRD13CQ8N6S4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ANKRD13CQ8N6S4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ANKRD13CQ8N6S4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ANKRD13CQ8N6S4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ANKRD13CQ8N6S4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ANKRD13CQ8N6S4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ANKRD13CQ8N6S4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ANKRD13CQ8N6S4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ANKRD13CQ8N6S4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ANKRD13CQ8N6S4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ANKRD13CQ8N6S4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ANKRD13CQ8N6S4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ANKRD13CQ8N6S4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ANKRD13CQ8N6S4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ANKRD13CQ8N6S4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ANKRD13CQ8N6S4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ANKRD13CQ8N6S4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ANKRD13CQ8N6S4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ANKRD13CQ8N6S4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ANKRD13CQ8N6S4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ANKRD13CQ8N6S4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ANKRD13CQ8N6S4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ANKRD13CQ8N6S4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms