Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
MSL3Q8N5Y2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
MSL3Q8N5Y2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MSL3Q8N5Y2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
MSL3Q8N5Y2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MSL3Q8N5Y2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
MSL3Q8N5Y2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
MSL3Q8N5Y2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
MSL3Q8N5Y2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
MSL3Q8N5Y2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MSL3Q8N5Y2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MSL3Q8N5Y2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MSL3Q8N5Y2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MSL3Q8N5Y2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
MSL3Q8N5Y2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MSL3Q8N5Y2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MSL3Q8N5Y2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
MSL3Q8N5Y2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
MSL3Q8N5Y2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MSL3Q8N5Y2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MSL3Q8N5Y2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MSL3Q8N5Y2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MSL3Q8N5Y2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MSL3Q8N5Y2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MSL3Q8N5Y2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MSL3Q8N5Y2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MSL3Q8N5Y2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MSL3Q8N5Y2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MSL3Q8N5Y2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MSL3Q8N5Y2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MSL3Q8N5Y2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MSL3Q8N5Y2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MSL3Q8N5Y2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
MSL3Q8N5Y2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MSL3Q8N5Y2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
MSL3Q8N5Y2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
MSL3Q8N5Y2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MSL3Q8N5Y2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
MSL3Q8N5Y2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MSL3Q8N5Y2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MSL3Q8N5Y2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MSL3Q8N5Y2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MSL3Q8N5Y2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MSL3Q8N5Y2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MSL3Q8N5Y2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MSL3Q8N5Y2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MSL3Q8N5Y2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MSL3Q8N5Y2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MSL3Q8N5Y2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
MSL3Q8N5Y2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MSL3Q8N5Y2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MSL3Q8N5Y2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MSL3Q8N5Y2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
MSL3Q8N5Y2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MSL3Q8N5Y2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
MSL3Q8N5Y2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MSL3Q8N5Y2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MSL3Q8N5Y2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MSL3Q8N5Y2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MSL3Q8N5Y2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MSL3Q8N5Y2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MSL3Q8N5Y2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MSL3Q8N5Y2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MSL3Q8N5Y2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MSL3Q8N5Y2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MSL3Q8N5Y2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MSL3Q8N5Y2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MSL3Q8N5Y2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MSL3Q8N5Y2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MSL3Q8N5Y2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MSL3Q8N5Y2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MSL3Q8N5Y2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MSL3Q8N5Y2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MSL3Q8N5Y2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MSL3Q8N5Y2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MSL3Q8N5Y2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MSL3Q8N5Y2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MSL3Q8N5Y2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MSL3Q8N5Y2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MSL3Q8N5Y2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MSL3Q8N5Y2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
MSL3Q8N5Y2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MSL3Q8N5Y2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MSL3Q8N5Y2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MSL3Q8N5Y2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
MSL3Q8N5Y2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MSL3Q8N5Y2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MSL3Q8N5Y2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MSL3Q8N5Y2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MSL3Q8N5Y2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MSL3Q8N5Y2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
MSL3Q8N5Y2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MSL3Q8N5Y2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MSL3Q8N5Y2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MSL3Q8N5Y2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MSL3Q8N5Y2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MSL3Q8N5Y2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MSL3Q8N5Y2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MSL3Q8N5Y2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MSL3Q8N5Y2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms