Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZJ3

CPAMD8, C3 and PZP-like alpha-2-macroglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPAMD8Q8IZJ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CPAMD8Q8IZJ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CPAMD8Q8IZJ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CPAMD8Q8IZJ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPAMD8Q8IZJ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPAMD8Q8IZJ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPAMD8Q8IZJ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CPAMD8Q8IZJ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPAMD8Q8IZJ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPAMD8Q8IZJ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPAMD8Q8IZJ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPAMD8Q8IZJ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPAMD8Q8IZJ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPAMD8Q8IZJ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPAMD8Q8IZJ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPAMD8Q8IZJ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPAMD8Q8IZJ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPAMD8Q8IZJ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPAMD8Q8IZJ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPAMD8Q8IZJ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPAMD8Q8IZJ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPAMD8Q8IZJ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPAMD8Q8IZJ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPAMD8Q8IZJ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPAMD8Q8IZJ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPAMD8Q8IZJ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPAMD8Q8IZJ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPAMD8Q8IZJ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPAMD8Q8IZJ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPAMD8Q8IZJ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPAMD8Q8IZJ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPAMD8Q8IZJ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPAMD8Q8IZJ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPAMD8Q8IZJ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPAMD8Q8IZJ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPAMD8Q8IZJ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPAMD8Q8IZJ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPAMD8Q8IZJ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPAMD8Q8IZJ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPAMD8Q8IZJ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CPAMD8Q8IZJ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPAMD8Q8IZJ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPAMD8Q8IZJ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CPAMD8Q8IZJ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPAMD8Q8IZJ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPAMD8Q8IZJ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPAMD8Q8IZJ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPAMD8Q8IZJ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CPAMD8Q8IZJ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPAMD8Q8IZJ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPAMD8Q8IZJ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPAMD8Q8IZJ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPAMD8Q8IZJ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPAMD8Q8IZJ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPAMD8Q8IZJ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPAMD8Q8IZJ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPAMD8Q8IZJ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPAMD8Q8IZJ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPAMD8Q8IZJ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPAMD8Q8IZJ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CPAMD8Q8IZJ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPAMD8Q8IZJ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPAMD8Q8IZJ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPAMD8Q8IZJ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPAMD8Q8IZJ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPAMD8Q8IZJ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPAMD8Q8IZJ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPAMD8Q8IZJ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPAMD8Q8IZJ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPAMD8Q8IZJ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPAMD8Q8IZJ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPAMD8Q8IZJ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPAMD8Q8IZJ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPAMD8Q8IZJ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPAMD8Q8IZJ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPAMD8Q8IZJ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPAMD8Q8IZJ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPAMD8Q8IZJ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPAMD8Q8IZJ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPAMD8Q8IZJ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPAMD8Q8IZJ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPAMD8Q8IZJ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPAMD8Q8IZJ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPAMD8Q8IZJ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPAMD8Q8IZJ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPAMD8Q8IZJ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPAMD8Q8IZJ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPAMD8Q8IZJ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPAMD8Q8IZJ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPAMD8Q8IZJ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPAMD8Q8IZJ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPAMD8Q8IZJ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPAMD8Q8IZJ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPAMD8Q8IZJ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPAMD8Q8IZJ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPAMD8Q8IZJ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPAMD8Q8IZJ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPAMD8Q8IZJ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPAMD8Q8IZJ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CPAMD8Q8IZJ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms