Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SFR1Q86XK3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SFR1Q86XK3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
SFR1Q86XK3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SFR1Q86XK3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SFR1Q86XK3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SFR1Q86XK3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SFR1Q86XK3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SFR1Q86XK3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SFR1Q86XK3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SFR1Q86XK3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SFR1Q86XK3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SFR1Q86XK3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SFR1Q86XK3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SFR1Q86XK3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SFR1Q86XK3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SFR1Q86XK3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SFR1Q86XK3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SFR1Q86XK3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SFR1Q86XK3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SFR1Q86XK3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SFR1Q86XK3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SFR1Q86XK3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SFR1Q86XK3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SFR1Q86XK3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SFR1Q86XK3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SFR1Q86XK3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SFR1Q86XK3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SFR1Q86XK3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SFR1Q86XK3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SFR1Q86XK3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SFR1Q86XK3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SFR1Q86XK3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SFR1Q86XK3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SFR1Q86XK3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SFR1Q86XK3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SFR1Q86XK3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SFR1Q86XK3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SFR1Q86XK3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SFR1Q86XK3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SFR1Q86XK3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SFR1Q86XK3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SFR1Q86XK3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SFR1Q86XK3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SFR1Q86XK3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SFR1Q86XK3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SFR1Q86XK3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SFR1Q86XK3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SFR1Q86XK3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SFR1Q86XK3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SFR1Q86XK3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SFR1Q86XK3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SFR1Q86XK3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SFR1Q86XK3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SFR1Q86XK3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SFR1Q86XK3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SFR1Q86XK3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SFR1Q86XK3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SFR1Q86XK3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SFR1Q86XK3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SFR1Q86XK3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SFR1Q86XK3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SFR1Q86XK3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SFR1Q86XK3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SFR1Q86XK3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SFR1Q86XK3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SFR1Q86XK3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SFR1Q86XK3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SFR1Q86XK3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SFR1Q86XK3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SFR1Q86XK3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SFR1Q86XK3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SFR1Q86XK3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SFR1Q86XK3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SFR1Q86XK3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SFR1Q86XK3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SFR1Q86XK3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SFR1Q86XK3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SFR1Q86XK3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SFR1Q86XK3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SFR1Q86XK3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SFR1Q86XK3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SFR1Q86XK3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SFR1Q86XK3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SFR1Q86XK3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SFR1Q86XK3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SFR1Q86XK3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SFR1Q86XK3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SFR1Q86XK3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SFR1Q86XK3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SFR1Q86XK3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SFR1Q86XK3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SFR1Q86XK3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SFR1Q86XK3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SFR1Q86XK3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SFR1Q86XK3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SFR1Q86XK3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SFR1Q86XK3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SFR1Q86XK3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SFR1Q86XK3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms