Protein–RNA interactions for Protein: Q86W56

PARG, Poly(ADP-ribose) glycohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARGQ86W56 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PARGQ86W56 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PARGQ86W56 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PARGQ86W56 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PARGQ86W56 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PARGQ86W56 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PARGQ86W56 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PARGQ86W56 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PARGQ86W56 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PARGQ86W56 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PARGQ86W56 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
PARGQ86W56 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PARGQ86W56 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PARGQ86W56 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PARGQ86W56 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PARGQ86W56 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARGQ86W56 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PARGQ86W56 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PARGQ86W56 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PARGQ86W56 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARGQ86W56 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARGQ86W56 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PARGQ86W56 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PARGQ86W56 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARGQ86W56 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARGQ86W56 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARGQ86W56 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARGQ86W56 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARGQ86W56 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PARGQ86W56 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PARGQ86W56 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PARGQ86W56 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PARGQ86W56 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARGQ86W56 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARGQ86W56 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARGQ86W56 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARGQ86W56 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PARGQ86W56 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARGQ86W56 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARGQ86W56 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARGQ86W56 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PARGQ86W56 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PARGQ86W56 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARGQ86W56 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PARGQ86W56 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARGQ86W56 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARGQ86W56 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARGQ86W56 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARGQ86W56 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PARGQ86W56 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARGQ86W56 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARGQ86W56 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARGQ86W56 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARGQ86W56 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARGQ86W56 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARGQ86W56 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARGQ86W56 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARGQ86W56 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARGQ86W56 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PARGQ86W56 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARGQ86W56 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARGQ86W56 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PARGQ86W56 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARGQ86W56 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARGQ86W56 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARGQ86W56 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARGQ86W56 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARGQ86W56 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARGQ86W56 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARGQ86W56 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARGQ86W56 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARGQ86W56 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARGQ86W56 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARGQ86W56 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARGQ86W56 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARGQ86W56 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARGQ86W56 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARGQ86W56 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARGQ86W56 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARGQ86W56 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARGQ86W56 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARGQ86W56 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARGQ86W56 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARGQ86W56 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PARGQ86W56 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARGQ86W56 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARGQ86W56 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARGQ86W56 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARGQ86W56 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARGQ86W56 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARGQ86W56 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PARGQ86W56 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PARGQ86W56 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PARGQ86W56 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PARGQ86W56 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARGQ86W56 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARGQ86W56 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARGQ86W56 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARGQ86W56 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARGQ86W56 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms