Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z699

SPRED1, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1Q7Z699 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SPRED1Q7Z699 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPRED1Q7Z699 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPRED1Q7Z699 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPRED1Q7Z699 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SPRED1Q7Z699 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPRED1Q7Z699 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPRED1Q7Z699 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPRED1Q7Z699 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPRED1Q7Z699 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SPRED1Q7Z699 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SPRED1Q7Z699 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SPRED1Q7Z699 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SPRED1Q7Z699 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SPRED1Q7Z699 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SPRED1Q7Z699 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SPRED1Q7Z699 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SPRED1Q7Z699 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SPRED1Q7Z699 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SPRED1Q7Z699 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SPRED1Q7Z699 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SPRED1Q7Z699 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SPRED1Q7Z699 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SPRED1Q7Z699 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SPRED1Q7Z699 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SPRED1Q7Z699 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SPRED1Q7Z699 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SPRED1Q7Z699 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SPRED1Q7Z699 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPRED1Q7Z699 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPRED1Q7Z699 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPRED1Q7Z699 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPRED1Q7Z699 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPRED1Q7Z699 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPRED1Q7Z699 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPRED1Q7Z699 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPRED1Q7Z699 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPRED1Q7Z699 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPRED1Q7Z699 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPRED1Q7Z699 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPRED1Q7Z699 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPRED1Q7Z699 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPRED1Q7Z699 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPRED1Q7Z699 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPRED1Q7Z699 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPRED1Q7Z699 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPRED1Q7Z699 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPRED1Q7Z699 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SPRED1Q7Z699 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPRED1Q7Z699 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SPRED1Q7Z699 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPRED1Q7Z699 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SPRED1Q7Z699 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPRED1Q7Z699 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPRED1Q7Z699 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPRED1Q7Z699 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPRED1Q7Z699 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPRED1Q7Z699 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPRED1Q7Z699 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPRED1Q7Z699 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPRED1Q7Z699 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPRED1Q7Z699 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPRED1Q7Z699 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPRED1Q7Z699 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPRED1Q7Z699 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPRED1Q7Z699 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPRED1Q7Z699 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPRED1Q7Z699 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRED1Q7Z699 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPRED1Q7Z699 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRED1Q7Z699 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPRED1Q7Z699 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRED1Q7Z699 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRED1Q7Z699 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPRED1Q7Z699 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPRED1Q7Z699 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPRED1Q7Z699 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRED1Q7Z699 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPRED1Q7Z699 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPRED1Q7Z699 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPRED1Q7Z699 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPRED1Q7Z699 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPRED1Q7Z699 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPRED1Q7Z699 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPRED1Q7Z699 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPRED1Q7Z699 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPRED1Q7Z699 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPRED1Q7Z699 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPRED1Q7Z699 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPRED1Q7Z699 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPRED1Q7Z699 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPRED1Q7Z699 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SPRED1Q7Z699 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPRED1Q7Z699 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPRED1Q7Z699 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPRED1Q7Z699 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPRED1Q7Z699 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPRED1Q7Z699 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPRED1Q7Z699 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPRED1Q7Z699 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms