Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
MICAL3Q7RTP6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MICAL3Q7RTP6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
MICAL3Q7RTP6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MICAL3Q7RTP6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
MICAL3Q7RTP6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MICAL3Q7RTP6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MICAL3Q7RTP6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
MICAL3Q7RTP6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MICAL3Q7RTP6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MICAL3Q7RTP6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MICAL3Q7RTP6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MICAL3Q7RTP6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MICAL3Q7RTP6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MICAL3Q7RTP6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MICAL3Q7RTP6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MICAL3Q7RTP6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MICAL3Q7RTP6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MICAL3Q7RTP6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MICAL3Q7RTP6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MICAL3Q7RTP6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MICAL3Q7RTP6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MICAL3Q7RTP6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MICAL3Q7RTP6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MICAL3Q7RTP6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MICAL3Q7RTP6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MICAL3Q7RTP6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MICAL3Q7RTP6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MICAL3Q7RTP6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MICAL3Q7RTP6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MICAL3Q7RTP6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MICAL3Q7RTP6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MICAL3Q7RTP6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MICAL3Q7RTP6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MICAL3Q7RTP6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
MICAL3Q7RTP6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MICAL3Q7RTP6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
MICAL3Q7RTP6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MICAL3Q7RTP6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MICAL3Q7RTP6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MICAL3Q7RTP6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MICAL3Q7RTP6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MICAL3Q7RTP6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MICAL3Q7RTP6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
MICAL3Q7RTP6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
MICAL3Q7RTP6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MICAL3Q7RTP6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MICAL3Q7RTP6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MICAL3Q7RTP6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MICAL3Q7RTP6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MICAL3Q7RTP6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MICAL3Q7RTP6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MICAL3Q7RTP6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MICAL3Q7RTP6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MICAL3Q7RTP6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MICAL3Q7RTP6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MICAL3Q7RTP6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MICAL3Q7RTP6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MICAL3Q7RTP6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MICAL3Q7RTP6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MICAL3Q7RTP6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MICAL3Q7RTP6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MICAL3Q7RTP6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MICAL3Q7RTP6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MICAL3Q7RTP6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MICAL3Q7RTP6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MICAL3Q7RTP6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MICAL3Q7RTP6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MICAL3Q7RTP6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MICAL3Q7RTP6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MICAL3Q7RTP6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MICAL3Q7RTP6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MICAL3Q7RTP6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MICAL3Q7RTP6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MICAL3Q7RTP6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MICAL3Q7RTP6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MICAL3Q7RTP6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MICAL3Q7RTP6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MICAL3Q7RTP6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
MICAL3Q7RTP6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MICAL3Q7RTP6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MICAL3Q7RTP6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
MICAL3Q7RTP6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MICAL3Q7RTP6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MICAL3Q7RTP6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MICAL3Q7RTP6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MICAL3Q7RTP6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MICAL3Q7RTP6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MICAL3Q7RTP6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MICAL3Q7RTP6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MICAL3Q7RTP6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MICAL3Q7RTP6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MICAL3Q7RTP6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MICAL3Q7RTP6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MICAL3Q7RTP6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MICAL3Q7RTP6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
MICAL3Q7RTP6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MICAL3Q7RTP6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MICAL3Q7RTP6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MICAL3Q7RTP6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms