Protein–RNA interactions for Protein: Q6TGC4

PADI6, Protein-arginine deiminase type-6, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI6Q6TGC4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PADI6Q6TGC4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PADI6Q6TGC4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PADI6Q6TGC4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
PADI6Q6TGC4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PADI6Q6TGC4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PADI6Q6TGC4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PADI6Q6TGC4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PADI6Q6TGC4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PADI6Q6TGC4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PADI6Q6TGC4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PADI6Q6TGC4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PADI6Q6TGC4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PADI6Q6TGC4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PADI6Q6TGC4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PADI6Q6TGC4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PADI6Q6TGC4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PADI6Q6TGC4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PADI6Q6TGC4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PADI6Q6TGC4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PADI6Q6TGC4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PADI6Q6TGC4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PADI6Q6TGC4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PADI6Q6TGC4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PADI6Q6TGC4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PADI6Q6TGC4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PADI6Q6TGC4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PADI6Q6TGC4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PADI6Q6TGC4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PADI6Q6TGC4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PADI6Q6TGC4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PADI6Q6TGC4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PADI6Q6TGC4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PADI6Q6TGC4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PADI6Q6TGC4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PADI6Q6TGC4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PADI6Q6TGC4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PADI6Q6TGC4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PADI6Q6TGC4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PADI6Q6TGC4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PADI6Q6TGC4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PADI6Q6TGC4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PADI6Q6TGC4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PADI6Q6TGC4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PADI6Q6TGC4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PADI6Q6TGC4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PADI6Q6TGC4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PADI6Q6TGC4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PADI6Q6TGC4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PADI6Q6TGC4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PADI6Q6TGC4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PADI6Q6TGC4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PADI6Q6TGC4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PADI6Q6TGC4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PADI6Q6TGC4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PADI6Q6TGC4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PADI6Q6TGC4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PADI6Q6TGC4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PADI6Q6TGC4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PADI6Q6TGC4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PADI6Q6TGC4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PADI6Q6TGC4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PADI6Q6TGC4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PADI6Q6TGC4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PADI6Q6TGC4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PADI6Q6TGC4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PADI6Q6TGC4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PADI6Q6TGC4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PADI6Q6TGC4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PADI6Q6TGC4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PADI6Q6TGC4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PADI6Q6TGC4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PADI6Q6TGC4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PADI6Q6TGC4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PADI6Q6TGC4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PADI6Q6TGC4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PADI6Q6TGC4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PADI6Q6TGC4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PADI6Q6TGC4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PADI6Q6TGC4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PADI6Q6TGC4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PADI6Q6TGC4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PADI6Q6TGC4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PADI6Q6TGC4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PADI6Q6TGC4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PADI6Q6TGC4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PADI6Q6TGC4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PADI6Q6TGC4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PADI6Q6TGC4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PADI6Q6TGC4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PADI6Q6TGC4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PADI6Q6TGC4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PADI6Q6TGC4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PADI6Q6TGC4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PADI6Q6TGC4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PADI6Q6TGC4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PADI6Q6TGC4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PADI6Q6TGC4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PADI6Q6TGC4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PADI6Q6TGC4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms