Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRAMEF9Q5VWM5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRAMEF9Q5VWM5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAMEF9Q5VWM5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PRAMEF9Q5VWM5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRAMEF9Q5VWM5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRAMEF9Q5VWM5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRAMEF9Q5VWM5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRAMEF9Q5VWM5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRAMEF9Q5VWM5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRAMEF9Q5VWM5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRAMEF9Q5VWM5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRAMEF9Q5VWM5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRAMEF9Q5VWM5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF9Q5VWM5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRAMEF9Q5VWM5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRAMEF9Q5VWM5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRAMEF9Q5VWM5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRAMEF9Q5VWM5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF9Q5VWM5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRAMEF9Q5VWM5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF9Q5VWM5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRAMEF9Q5VWM5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRAMEF9Q5VWM5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRAMEF9Q5VWM5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF9Q5VWM5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF9Q5VWM5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF9Q5VWM5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF9Q5VWM5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF9Q5VWM5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRAMEF9Q5VWM5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRAMEF9Q5VWM5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRAMEF9Q5VWM5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRAMEF9Q5VWM5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRAMEF9Q5VWM5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF9Q5VWM5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRAMEF9Q5VWM5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF9Q5VWM5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF9Q5VWM5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF9Q5VWM5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF9Q5VWM5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF9Q5VWM5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF9Q5VWM5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRAMEF9Q5VWM5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRAMEF9Q5VWM5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF9Q5VWM5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF9Q5VWM5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF9Q5VWM5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF9Q5VWM5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF9Q5VWM5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF9Q5VWM5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF9Q5VWM5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF9Q5VWM5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF9Q5VWM5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF9Q5VWM5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF9Q5VWM5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF9Q5VWM5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF9Q5VWM5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF9Q5VWM5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF9Q5VWM5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF9Q5VWM5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF9Q5VWM5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF9Q5VWM5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF9Q5VWM5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF9Q5VWM5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF9Q5VWM5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF9Q5VWM5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF9Q5VWM5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF9Q5VWM5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF9Q5VWM5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF9Q5VWM5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF9Q5VWM5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF9Q5VWM5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF9Q5VWM5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF9Q5VWM5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF9Q5VWM5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRAMEF9Q5VWM5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF9Q5VWM5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF9Q5VWM5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF9Q5VWM5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF9Q5VWM5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF9Q5VWM5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF9Q5VWM5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF9Q5VWM5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF9Q5VWM5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF9Q5VWM5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF9Q5VWM5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF9Q5VWM5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF9Q5VWM5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF9Q5VWM5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF9Q5VWM5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF9Q5VWM5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF9Q5VWM5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF9Q5VWM5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF9Q5VWM5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF9Q5VWM5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF9Q5VWM5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF9Q5VWM5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF9Q5VWM5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms