Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.38
RAB41Q5JT25 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RAB41Q5JT25 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RAB41Q5JT25 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RAB41Q5JT25 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RAB41Q5JT25 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RAB41Q5JT25 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAB41Q5JT25 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAB41Q5JT25 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RAB41Q5JT25 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB41Q5JT25 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAB41Q5JT25 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB41Q5JT25 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RAB41Q5JT25 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAB41Q5JT25 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB41Q5JT25 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB41Q5JT25 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAB41Q5JT25 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAB41Q5JT25 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RAB41Q5JT25 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAB41Q5JT25 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAB41Q5JT25 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RAB41Q5JT25 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB41Q5JT25 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RAB41Q5JT25 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RAB41Q5JT25 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RAB41Q5JT25 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RAB41Q5JT25 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RAB41Q5JT25 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RAB41Q5JT25 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB41Q5JT25 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAB41Q5JT25 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAB41Q5JT25 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAB41Q5JT25 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAB41Q5JT25 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RAB41Q5JT25 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RAB41Q5JT25 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAB41Q5JT25 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RAB41Q5JT25 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAB41Q5JT25 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAB41Q5JT25 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAB41Q5JT25 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RAB41Q5JT25 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RAB41Q5JT25 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RAB41Q5JT25 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAB41Q5JT25 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RAB41Q5JT25 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
RAB41Q5JT25 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RAB41Q5JT25 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAB41Q5JT25 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RAB41Q5JT25 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAB41Q5JT25 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAB41Q5JT25 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAB41Q5JT25 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RAB41Q5JT25 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RAB41Q5JT25 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB41Q5JT25 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAB41Q5JT25 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAB41Q5JT25 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
RAB41Q5JT25 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RAB41Q5JT25 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAB41Q5JT25 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAB41Q5JT25 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
RAB41Q5JT25 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAB41Q5JT25 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAB41Q5JT25 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RAB41Q5JT25 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RAB41Q5JT25 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RAB41Q5JT25 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RAB41Q5JT25 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RAB41Q5JT25 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RAB41Q5JT25 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RAB41Q5JT25 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAB41Q5JT25 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAB41Q5JT25 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RAB41Q5JT25 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAB41Q5JT25 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAB41Q5JT25 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB41Q5JT25 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB41Q5JT25 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB41Q5JT25 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB41Q5JT25 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB41Q5JT25 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB41Q5JT25 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RAB41Q5JT25 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RAB41Q5JT25 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RAB41Q5JT25 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB41Q5JT25 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAB41Q5JT25 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAB41Q5JT25 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAB41Q5JT25 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB41Q5JT25 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB41Q5JT25 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAB41Q5JT25 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RAB41Q5JT25 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RAB41Q5JT25 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RAB41Q5JT25 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RAB41Q5JT25 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAB41Q5JT25 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAB41Q5JT25 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms