Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
HSP90AB3PQ58FF7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
HSP90AB3PQ58FF7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HSP90AB3PQ58FF7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
HSP90AB3PQ58FF7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
HSP90AB3PQ58FF7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
HSP90AB3PQ58FF7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HSP90AB3PQ58FF7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
HSP90AB3PQ58FF7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
HSP90AB3PQ58FF7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
HSP90AB3PQ58FF7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
HSP90AB3PQ58FF7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
HSP90AB3PQ58FF7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
HSP90AB3PQ58FF7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
HSP90AB3PQ58FF7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
HSP90AB3PQ58FF7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
HSP90AB3PQ58FF7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
HSP90AB3PQ58FF7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HSP90AB3PQ58FF7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
HSP90AB3PQ58FF7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HSP90AB3PQ58FF7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
HSP90AB3PQ58FF7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HSP90AB3PQ58FF7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
HSP90AB3PQ58FF7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
HSP90AB3PQ58FF7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
HSP90AB3PQ58FF7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
HSP90AB3PQ58FF7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
HSP90AB3PQ58FF7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
HSP90AB3PQ58FF7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
HSP90AB3PQ58FF7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
HSP90AB3PQ58FF7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
HSP90AB3PQ58FF7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
HSP90AB3PQ58FF7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HSP90AB3PQ58FF7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
HSP90AB3PQ58FF7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
HSP90AB3PQ58FF7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HSP90AB3PQ58FF7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
HSP90AB3PQ58FF7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
HSP90AB3PQ58FF7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HSP90AB3PQ58FF7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
HSP90AB3PQ58FF7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HSP90AB3PQ58FF7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HSP90AB3PQ58FF7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HSP90AB3PQ58FF7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
HSP90AB3PQ58FF7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
HSP90AB3PQ58FF7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
HSP90AB3PQ58FF7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HSP90AB3PQ58FF7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
HSP90AB3PQ58FF7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
HSP90AB3PQ58FF7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
HSP90AB3PQ58FF7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
HSP90AB3PQ58FF7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
HSP90AB3PQ58FF7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HSP90AB3PQ58FF7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
HSP90AB3PQ58FF7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HSP90AB3PQ58FF7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HSP90AB3PQ58FF7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HSP90AB3PQ58FF7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HSP90AB3PQ58FF7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
HSP90AB3PQ58FF7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
HSP90AB3PQ58FF7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HSP90AB3PQ58FF7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HSP90AB3PQ58FF7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HSP90AB3PQ58FF7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HSP90AB3PQ58FF7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HSP90AB3PQ58FF7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HSP90AB3PQ58FF7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HSP90AB3PQ58FF7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HSP90AB3PQ58FF7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HSP90AB3PQ58FF7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
HSP90AB3PQ58FF7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
HSP90AB3PQ58FF7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HSP90AB3PQ58FF7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
HSP90AB3PQ58FF7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HSP90AB3PQ58FF7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HSP90AB3PQ58FF7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HSP90AB3PQ58FF7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HSP90AB3PQ58FF7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HSP90AB3PQ58FF7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
HSP90AB3PQ58FF7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HSP90AB3PQ58FF7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
HSP90AB3PQ58FF7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HSP90AB3PQ58FF7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HSP90AB3PQ58FF7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HSP90AB3PQ58FF7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HSP90AB3PQ58FF7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HSP90AB3PQ58FF7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HSP90AB3PQ58FF7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
HSP90AB3PQ58FF7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
HSP90AB3PQ58FF7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
HSP90AB3PQ58FF7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
HSP90AB3PQ58FF7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HSP90AB3PQ58FF7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HSP90AB3PQ58FF7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HSP90AB3PQ58FF7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HSP90AB3PQ58FF7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HSP90AB3PQ58FF7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms