Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0Z9

MCMDC2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMDC2Q4G0Z9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
MCMDC2Q4G0Z9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
MCMDC2Q4G0Z9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
MCMDC2Q4G0Z9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
MCMDC2Q4G0Z9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
MCMDC2Q4G0Z9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
MCMDC2Q4G0Z9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
MCMDC2Q4G0Z9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
MCMDC2Q4G0Z9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MCMDC2Q4G0Z9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
MCMDC2Q4G0Z9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
MCMDC2Q4G0Z9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
MCMDC2Q4G0Z9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
MCMDC2Q4G0Z9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
MCMDC2Q4G0Z9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MCMDC2Q4G0Z9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
MCMDC2Q4G0Z9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MCMDC2Q4G0Z9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
MCMDC2Q4G0Z9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
MCMDC2Q4G0Z9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
MCMDC2Q4G0Z9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MCMDC2Q4G0Z9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
MCMDC2Q4G0Z9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
MCMDC2Q4G0Z9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MCMDC2Q4G0Z9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MCMDC2Q4G0Z9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MCMDC2Q4G0Z9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
MCMDC2Q4G0Z9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MCMDC2Q4G0Z9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MCMDC2Q4G0Z9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
MCMDC2Q4G0Z9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MCMDC2Q4G0Z9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MCMDC2Q4G0Z9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MCMDC2Q4G0Z9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MCMDC2Q4G0Z9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
MCMDC2Q4G0Z9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
MCMDC2Q4G0Z9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MCMDC2Q4G0Z9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MCMDC2Q4G0Z9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MCMDC2Q4G0Z9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MCMDC2Q4G0Z9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MCMDC2Q4G0Z9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MCMDC2Q4G0Z9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MCMDC2Q4G0Z9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
MCMDC2Q4G0Z9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
MCMDC2Q4G0Z9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
MCMDC2Q4G0Z9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
MCMDC2Q4G0Z9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MCMDC2Q4G0Z9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MCMDC2Q4G0Z9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MCMDC2Q4G0Z9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MCMDC2Q4G0Z9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MCMDC2Q4G0Z9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
MCMDC2Q4G0Z9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MCMDC2Q4G0Z9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
MCMDC2Q4G0Z9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MCMDC2Q4G0Z9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MCMDC2Q4G0Z9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MCMDC2Q4G0Z9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MCMDC2Q4G0Z9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MCMDC2Q4G0Z9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MCMDC2Q4G0Z9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
MCMDC2Q4G0Z9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MCMDC2Q4G0Z9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MCMDC2Q4G0Z9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MCMDC2Q4G0Z9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MCMDC2Q4G0Z9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MCMDC2Q4G0Z9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MCMDC2Q4G0Z9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
MCMDC2Q4G0Z9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MCMDC2Q4G0Z9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MCMDC2Q4G0Z9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MCMDC2Q4G0Z9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MCMDC2Q4G0Z9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MCMDC2Q4G0Z9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
MCMDC2Q4G0Z9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
MCMDC2Q4G0Z9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MCMDC2Q4G0Z9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MCMDC2Q4G0Z9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
MCMDC2Q4G0Z9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MCMDC2Q4G0Z9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MCMDC2Q4G0Z9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MCMDC2Q4G0Z9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
MCMDC2Q4G0Z9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MCMDC2Q4G0Z9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MCMDC2Q4G0Z9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MCMDC2Q4G0Z9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MCMDC2Q4G0Z9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MCMDC2Q4G0Z9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MCMDC2Q4G0Z9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MCMDC2Q4G0Z9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MCMDC2Q4G0Z9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MCMDC2Q4G0Z9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MCMDC2Q4G0Z9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
MCMDC2Q4G0Z9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MCMDC2Q4G0Z9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MCMDC2Q4G0Z9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MCMDC2Q4G0Z9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MCMDC2Q4G0Z9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms