Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Q4G0T1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Q4G0T1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Q4G0T1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Q4G0T1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Q4G0T1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Q4G0T1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Q4G0T1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Q4G0T1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Q4G0T1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Q4G0T1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Q4G0T1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Q4G0T1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Q4G0T1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Q4G0T1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Q4G0T1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Q4G0T1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Q4G0T1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Q4G0T1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Q4G0T1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Q4G0T1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Q4G0T1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Q4G0T1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Q4G0T1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Q4G0T1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Q4G0T1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Q4G0T1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Q4G0T1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Q4G0T1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Q4G0T1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Q4G0T1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Q4G0T1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Q4G0T1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Q4G0T1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Q4G0T1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Q4G0T1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Q4G0T1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Q4G0T1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Q4G0T1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Q4G0T1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Q4G0T1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Q4G0T1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Q4G0T1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Q4G0T1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Q4G0T1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Q4G0T1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Q4G0T1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Q4G0T1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Q4G0T1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Q4G0T1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Q4G0T1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Q4G0T1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Q4G0T1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Q4G0T1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Q4G0T1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Q4G0T1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Q4G0T1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Q4G0T1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Q4G0T1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Q4G0T1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Q4G0T1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Q4G0T1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Q4G0T1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Q4G0T1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Q4G0T1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Q4G0T1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Q4G0T1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Q4G0T1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Q4G0T1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Q4G0T1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Q4G0T1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Q4G0T1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Q4G0T1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Q4G0T1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Q4G0T1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Q4G0T1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Q4G0T1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Q4G0T1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
Q4G0T1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Q4G0T1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Q4G0T1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Q4G0T1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Q4G0T1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Q4G0T1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Q4G0T1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Q4G0T1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Q4G0T1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Q4G0T1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Q4G0T1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Q4G0T1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Q4G0T1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Q4G0T1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Q4G0T1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Q4G0T1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Q4G0T1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Q4G0T1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Q4G0T1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Q4G0T1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Q4G0T1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Q4G0T1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms