Protein–RNA interactions for Protein: Q495M9

USH1G, Usher syndrome type-1G protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1GQ495M9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
USH1GQ495M9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
USH1GQ495M9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
USH1GQ495M9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
USH1GQ495M9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
USH1GQ495M9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
USH1GQ495M9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
USH1GQ495M9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
USH1GQ495M9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
USH1GQ495M9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
USH1GQ495M9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
USH1GQ495M9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
USH1GQ495M9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
USH1GQ495M9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
USH1GQ495M9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
USH1GQ495M9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
USH1GQ495M9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
USH1GQ495M9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
USH1GQ495M9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
USH1GQ495M9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
USH1GQ495M9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
USH1GQ495M9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
USH1GQ495M9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
USH1GQ495M9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
USH1GQ495M9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USH1GQ495M9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USH1GQ495M9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USH1GQ495M9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
USH1GQ495M9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
USH1GQ495M9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
USH1GQ495M9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
USH1GQ495M9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
USH1GQ495M9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
USH1GQ495M9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
USH1GQ495M9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
USH1GQ495M9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
USH1GQ495M9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
USH1GQ495M9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
USH1GQ495M9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
USH1GQ495M9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
USH1GQ495M9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
USH1GQ495M9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
USH1GQ495M9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
USH1GQ495M9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
USH1GQ495M9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
USH1GQ495M9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
USH1GQ495M9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
USH1GQ495M9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
USH1GQ495M9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
USH1GQ495M9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USH1GQ495M9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
USH1GQ495M9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
USH1GQ495M9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
USH1GQ495M9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
USH1GQ495M9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
USH1GQ495M9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
USH1GQ495M9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
USH1GQ495M9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USH1GQ495M9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
USH1GQ495M9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
USH1GQ495M9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
USH1GQ495M9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USH1GQ495M9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USH1GQ495M9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USH1GQ495M9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USH1GQ495M9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USH1GQ495M9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USH1GQ495M9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USH1GQ495M9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USH1GQ495M9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USH1GQ495M9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USH1GQ495M9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USH1GQ495M9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USH1GQ495M9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
USH1GQ495M9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USH1GQ495M9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USH1GQ495M9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
USH1GQ495M9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
USH1GQ495M9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
USH1GQ495M9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
USH1GQ495M9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USH1GQ495M9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USH1GQ495M9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
USH1GQ495M9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USH1GQ495M9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USH1GQ495M9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USH1GQ495M9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
USH1GQ495M9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USH1GQ495M9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USH1GQ495M9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USH1GQ495M9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USH1GQ495M9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USH1GQ495M9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USH1GQ495M9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USH1GQ495M9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
USH1GQ495M9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USH1GQ495M9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
USH1GQ495M9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
USH1GQ495M9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USH1GQ495M9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms